癌症免疫疗法最新进展：TIL(肿瘤浸润淋巴细胞)
高通量测序技术促进了癌症和免疫学的研究，以及个体化免疫治疗的发展，比如说，高通量测序极大地促进了我们对癌症基因组，肿瘤发生过程中细胞内机制的了解，而且癌症基因组分析还揭示了免疫系统能靶向的抗原表位。同时测序也可以用于确定免疫组库，实时，高敏感地监控对肿瘤生长或治疗产生应答的克隆扩增和细胞群体浓度。
肿瘤浸润淋巴细胞（tumor infiltrating lymphocyte,TIL）是指那些离开血流进入到肿瘤中的白细胞。当存在大量的肿瘤浸润淋巴细胞时，表明机体启动了对抗肿瘤的免疫反应。在许多的癌症中，研究人员均开展了相关的研究，定量这些肿瘤浸润细胞，并将其数量与肿瘤特征和结果关联起来。
2013年，Rosenberg领导的团队率先采用外显子测序技术，鉴别在患者中表达的突变蛋白，并用一种 MHC分子-抗原表位亲和力算法进行模拟预测评估，进而合成候选的抗原表位，开展免疫反应验证。通过此方法，研究人员能快速鉴别出了在患者肿瘤 细胞上表达，能被肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）识别的突变抗原。
2014 年，Rosenberg团队将该方法成功应用到临床，他们通过高深度外显子测序技术、免疫反应功能验证，筛选出一位转移性胆管癌患者的高频突变基因，并鉴定到其对应的TIL克隆，通过大量扩增该TIL克隆 并实施回输治疗，使患者的病情得到有效控制。 2014年底，另一个研究团队联合应用外显子测序技术、转录组测序技术、高通量蛋白质谱分析技术，及 MHC分子-抗原表位亲和力模拟预测技术，寻找到 能被T细胞识别从而高效激活免疫反应的多肽疫 苗，该个性化肿瘤疫苗兼具预防性疫苗与治疗性疫苗的效能。这篇综述主要介绍了其中相关的内容。
美国国家癌症研究所等机构的科学家们开发出了一种新的流线化方法，可快速鉴别出黑色素瘤中可被肿瘤浸润淋巴细胞识别的独特突变抗原。过去的研究证实肿瘤浸润淋巴细胞能够减少癌症病变，这些独特的蛋白小片段是肿瘤浸润淋巴细胞的识别靶标。
在这项最新研究中，科学家对患者过继转移了自身的免疫细胞，近40% 的患者在至少5 年的时间内肿瘤完全消退。为了更好地了解它的作用机制，研究人员开发了一种新方法，有助于更快地筛查出这些肿瘤浸润淋巴细胞识别的突变抗原。
新方法采用了新一代 DNA 测序技术，挖掘全外显子序列数据，鉴别在患者中表达的突变蛋白。随后研究人员合成出候选的突变T细胞抗原表位，并用一种主要组织相容性复合物结合算法对候选表位进行了评估。利用这种方法，研究人员鉴别出了在患者肿瘤细胞上表达，能被肿瘤浸润淋巴细胞识别的突变抗原。
研究人员指出，新技术能够更快、更容易地鉴别出免疫系统T细胞识别的突变基因抗原。从前，研究人员都是通过生成以及费力地筛查来自肿瘤的DNA库，来完成这样的工作。这一新筛查技术有可能还适用于在许多癌症类型中鉴别突变抗原。
