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昆明动物所比较转录组学分析揭示分化的心血管疾病通路

2012.2.08

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人类与动物模型的比较转录组学分析揭示分化的心血管疾病通路

  在构建与发展人类疾病动物模型过程中,最根本的问题是要清楚疾病基因在模式动物中的功能保守性。动物模型被广泛的应用在心血管疾病的研究中。然而,利用这些动物模型进行实验,通常会发生实验结果达不到预期目标或者大相径庭的情况。

  为了深入探讨人类心血管疾病动物模型与人之间的差异,在中国科学院昆明动物研究所生物信息与系统生物学实验室黄京飞研究员的指导下,博士研究生赵玉琪与盛自章等对人类以及四种心血管疾病动物模型(小鼠,大鼠,猕猴,狗)的转录组进行了全面细致的比较。研究发现,尽管大部分基因受到强烈的负选择,但是有一些通路在动物模型与人间发生了分化。并且,不同的动物模型与人之间发生分化的通路不尽相同。共表达网络结果还显示,基因的表达演化并不是单独发生的,而是通过形成模块共同演化的。

  这项研究为更好地发展心血管疾病模型以及研究基因表达的演化,提供了有力的数据及方法学支持。

  该研究目前已在线发表于Molecular BioSystems。该工作得到国家自然基金和云南省自然基金等的大力支持。

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