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Science医学：首个胃癌表观遗传图谱
来自杜克-新加坡国大医学研究生院的研究人员在新研究中发现了大量由环境因素触发的胃癌新亚型。这项基于表观遗传学的新研究获得了对胃癌复杂性的新认识，有可能促成对这一仅次于肺癌的全球第二位癌症杀手更好的治疗策略。论文发表在10月17日的《科学转化医学》(Science Translational Medicine)杂志上。
论文的领导者、杜克-新加坡国大医学研究生院Patrick Tan 博士说“胃癌是一种异质性疾病，对于相同的治疗患者个体常常显示出明显不同的反应。改善胃癌的临床结果需要有能够将患者细分为生物学上相似亚群的方法，从而为每个群体设计出亚型特异性治疗。“
和许多的癌症一样，胃癌是由于遗传突变和影响基因运作方式的外部因子所造成。这些因子就称为表观遗传改变，通过甲基化来起作用。甲基化是指通过添加甲基团来修饰DNA的特异位点――CpG位点的一种化学过程。无需改变DNA序列，甲基化作用可导致某个基因的行为沉默。
在他们的研究中，Patrick Tan和同事们利用240个原发性肿瘤和细胞系第一全面调查了胃癌DNA甲基化图谱。他们的目的是要鉴别出并非由主要基因突变，尤其是那些有可能用治疗靶向的突变，引起的胃癌新分子亚型。
研究人员发现胃癌甲基化组(methylome)广泛分布，分析的CpG位点超过一半显示了癌症甲基化形式改变。许多的甲基化改变与基因表达显著改变相关，表明甲基化改变有可能在胃癌形成中具有功能重要性。
研究人员还发现一种胃癌亚群具有极高水平的甲基化。这一CIMP亚群(CpG岛甲基化表型)从前就有人提出，但对于其临床意义仍不清楚。杜克-新加坡国大医学研究生院研究小组证实这种CIMP亚型与预后差的年轻患者相关联。他们还在实验室实验中证实这些肿瘤对去甲基化药物的敏感性有可能增高。
Patrick Tan说：“我们的研究清晰明确地证实了这一亚群的存在和它的特征。更重要的，令我们感到受鼓舞的是测试这些CIMP肿瘤对于更有效的DNA去甲基化药物及其他可能的表观遗传药物的敏感性有可能具有潜在的功用。”
新研究还揭示了大范围的表观遗传沉默区域，一些靶向广泛区域，另一些靶向单个基因。这一发现有可能帮助鉴别出甲基化事件在肿瘤形成中起作用的新基因。
Patrick Tan说：“我们的结果强有力地证明了胃癌并不是一种疾病而是多种疾病的统称，每种疾病都具有不同的基本生物学和标志性的特征。如果胃癌是多个相互作用因子的结果，其中包括环境因子和宿主遗传因子，我们需要更好的途径来诊断和治疗它。”
“这些结果推动我们前进，另外的工作将侧重于开发出在更早阶段检测胃癌的简单诊断测试，以及有可能高效对抗疾病不同分子亚型的药物和药物靶点，”Patrick Tan说。
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