3.非洲爪蟾染色体外环状DNA的形成与端粒DNA相关
发表期刊：EMBO reports
影响因子：8.383
发表时间：2002.10.15
文章链接：Formation of extrachromosomal circles from telomeric DNA in Xenopus laevis

端粒DNA(包括染色体外DNA)的不稳定性和可塑性通常与端粒酶的缺失和哺乳动物细胞的异常生长有关。文章中作者在早期胚胎中检测到大量与端粒序列(tel-eccDNA)同源的松弛环，占细胞端粒DNA总含量的10%，并展示了在非洲爪蟾发育过程中染色体外端粒重复序列(tel-eccDNA)的形成。eccDNA是由脊椎动物的端粒重复序列(TTAGGG)组成的双链松弛环。其大小于<2 到>20 kb之间，占早期胚胎总细胞端粒含量的10%。tel-eccDNA的数量在发育后期和成人组织中减少。作者利用一种来自非洲爪蟾卵子的无细胞提取物发现tel - eccDNA可以从精子核的端粒染色体束和裸露的DNA中以一种不依赖复制的方式从头形成。这些结果表明在非洲爪蟾正常发育过程中的DNA端粒具有不寻常的可塑性。

4.果蝇中串联重复基因的滚环复制机理
发表期刊：Nucleic Acids Research
影响因子：11.147
发表时间：2005.7.26
文章链接：Evidence for rolling circle replication of tandem genes in Drosophila

染色体外环DNA (eccDNA)是真核生物基因组可塑性的一个特征。它存在于各种生物体中，包含主要来自重复染色体DNA的序列。作者利用二维凝胶电泳检测了果蝇eccDNA，发现在果蝇中eccDNA大小从<1 kb到> 20kb，占细胞总重复DNA的10%并存在于果蝇的整个生命周期中。此外作者首 次报道了果蝇中发生eccDNA滚动循环复制的证据，即在二维凝胶上展示了色谱法富集的特定结构，并在其他体系中作为滚环中间体（RCIs）进行了鉴定。这些RCIs与组蛋白基因同源，它们都以串联重复序列的形式存在于染色体中。基于此，作者认为滚环复制（RCR）可能发生在任何eccDNA上，将RCR产物重新整合到基因组中可能为真核生物基因组中串联重复扩增提供了一种新的机制。相反，从染色体中切除eccDNA可能在控制染色体重复数量和防止其过度膨胀方面发挥重要作用。

5.通过形成染色体环状DNA调控酿酒酵母组蛋白基因的扩增
发表期刊：Nature
影响因子：43.07
发表时间：2006.10.26
文章链接：Amplification of histone genes by circular chromosome formation in Saccharomyces cerevisiae
适当的组蛋白水平对转录、染色体分离和其他染色质介导的过程至关重要。在酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中，组蛋白H2A和H2B由HTA1-HTB1和HTA2-HTB2两对基因编码。前期研究表明，当HTA2-HTB2缺失时，HTA1-HTB1在转录水平上的表达量有补偿性的提高。本文提出，HTA2-HTB2通过一个小的环状染色体进行扩增。在包含39 kb的II染色体的复制中，包括了HTA2-HTB2、组蛋白H3-H4位点HHT1-HHF1、着丝粒和复制起点。新染色体的形成是由两侧的两个Ty1逆转录转座子组成的。减数分裂后，这两个特定Ty1元件的重组在hta1-htb1Δ突变体中具有很高的水平，表明减少的组蛋白H2A、H2B的水平刺激组蛋白基因的扩增。同时也证明了在酿酒酵母中能通过控制组蛋白基因的表达量来保持基因组的完整性。