关于微卫星标记的相关特点介绍

　　SSR 操作简单,仅需微量组织,即可使DNA 降解,进行有效地分析鉴定。其标记带型简单,记录条带一致,客观明确,PCR 技术的利用,使微卫星标记技术实现操作自动化。

　　与其它标记技术相比,具有以下特点：首先,在每个微卫星DNA 两端的序列多是相对保守的单拷贝序列,尤其在亲缘关系相近的物种间是保守的,而且在一些紧密相关的物种中其重复单位和重复次数具有一定的相似性。

　　其次,这些小的、串联排列的重复序列经常是通过核苷酸链的滑动错配或者其它未知的过程来改变它们的长度,从而导致微卫星在数量上的差异。微卫星的突变率高:每代每个配子的每个位点有25×10-5～1×10-2 突变,因此造成了它们的多态性。微卫星寡聚核苷酸的重复次数在同一物种的不同基因型间差异很大。微卫星通常是复等位的,代表每个微卫星位点的等位基因数目高度可变。微卫星DNA 的多态性比RFLP 显著增高,Russell 等对几种分子生物学方法(RFLP,AFLP,RAPD,SSR)进行了比较,分别检测18 个大麦品系的遗传多样性水平的变化情况,发现所有这些方法都能鉴别每一个品系,但各自反映的多态性程度不同。其中利用微卫星标记的13 对引物产物全部呈多态,平均每一对引物有5.7个等位基因。AFLP、RFLP 与RAPD 多态性片段分别为36.4%、83.2%和66.3%。进一步研究还发现,微卫星DNA 是中性的,微卫星DNA 标记呈共显性的孟德尔式遗传,能够鉴别杂合体,对隐性性状的选择十分有利,而且SSR 标记没有上位性效应,不受环境条件和其它因素的影响,表现为中性标记。与其它形态标记相比,具有极显著的优越性,且对植株的表现无影响。它具有比其它分子标记(如等位酶、RFLP、RAPD 等)更多的可检测等位基因,能够提供更细致的基因变化分析范围。