在第二代磁谱仪的研发中，东南大学承担的主要任务包括：建立磁谱仪模拟实验系统、反物质探测系统、数据处理和海量数据存储系统。其中，磁谱仪模拟实验系统能够模拟仪器上出现的任何问题，反物质探测系统是磁谱仪上若干层探测器的重要组成部分，而数据处理和海量数据存储系统将为科学家将来寻找反物质提供数据。

　　“磁谱仪在空间站运行过程中，会产生大量的数据，传输到美国国家航空航天局(NASA)，再由NASA传输到丁肇中负责的、位于日内瓦的欧洲核子研究中心。”

　　罗军舟说，研究中心会把数据传输到东南大学，进行分析。磁谱仪产生的数据量将达到420个T，相当于21个国家图书馆的藏书量。数据分析过程中，东南大学还将搭建一个数据平台，供参与这一项目的各国物理学家调取研究，反物质和暗物质到底能否发现，都将取决于这个数据分析平台。

　　据悉，第一代阿尔法磁谱仪的原型系统目前也陈列在东南大学的AMS01实验室内，供国内学者研究。