所用的免疫毒素也存在许多问题，如对靶组织的特异性杀伤作用弱，尤其对大型实体瘤的浸润性较差，在体内的免疫反应严重，难以真正过渡到临床应用。因而研制出只杀死相关的病理性自身反应性T细胞的有关免疫毒素是推动这一研究深入的关键。此外，许多免疫毒素在体内部都会引发不同程度的血管渗出综合症(VLS)。结合基础和临床研究现状，免疫毒素今后的发展方向为：将免疫毒素用于放疗化疗和骨髓移植后的辅助治疗，及病人体内微小残留病灶的清除；加强基础研究，研制新型的基因工程化的重组免疫素素，使其具备分子小、易扩散、免疫原性低的优点，以期成为肿瘤等顽症治疗的重要制剂之一。

　　近年出现了一系列由通过膜作用的毒素构建而成的新型免疫毒素。例如以蜂毒肽构建的免疫毒素，但对其应用的研究还处在初级阶段，短时间内还无法替代经典的免疫毒素形式。因此，选择高特异结合活性并能够有效内化的抗体是至关重要的。在构建免疫毒素中，应考虑选择合适的构建形式以使抗体与抗原结合作用不受影响，为得到活性高的免疫毒素还需从多方面对毒素加以优化和改造。研究成果和临床试验表明，免疫毒素将发展成为肿瘤靶向治疗中的一种新型而有效的治疗模式。