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双歧杆菌核酸检测试剂盒

2019.3.05

双歧杆菌核酸检测试剂盒

本试剂盒选取一对双歧杆菌(BD)特异性引物和一条特异性荧光探针,应用碱裂解法提取DNA,后者在耐热DNA聚合酶(Taq酶)作用下,配以FQ-Buffer(内含Mg2+、Tris-HCl等)、四种核苷酸单体(dNTPs)等成分,用PCR-荧光探针体外扩增法对双歧杆菌(BD)DNA进行扩增,从而达到快速定量检测之目的。

标本采集、保存和运输:
适用标本类型:食道、食品及乳制品(如乳酪、酸奶)及培养菌等样本。
标本采集:
食道内容物:取疑似动物或人食道(胃、十二指肠、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、直肠等)内食物残渣或粪便组织约100-200mg组织,转至一盛有1ml生理盐水的离心管中,密闭送检。
乳制品:取疑似乳制品1g(或1ml),转至一盛有1ml生理盐水的离心管中,密闭送检。
3. 保存和运输:上述标本短期内可保存于-20℃,长期保存可置-70℃。但不能超过6个月,标本运送应采用0℃冰。

使用方法
1.DNA提取
1.1食道内容物:充分混匀上述标本,将其转至一洁净的1.5ml 离心管中,13,000rpm离心1分钟,弃上清,加入1ml生理盐水,充分震荡,13,000rpm离心1分钟,弃上清,沉淀加250μl核酸提取液B 充分混匀(提取液用前需室温溶解并充分混匀)后100℃10分钟, 13,000rpm离心3分钟,取上清液250μl转至一洁净的1.5ml离心管中,加750μl无水乙醇,充分混匀,13,000rpm离心5分钟,尽量丢弃上清,空气中干燥5-10分钟,待乙醇挥发干净后加50μl阴性质控品溶液沉淀,后取4μl做PCR反应。
1.2 培养菌:直接取100μl菌液,转移至1.5ml离心管中,13,000rpm离心5分钟;去上清,沉淀中加入50μl DNA核酸提取液B充分混匀。100℃恒温处理10分钟;13,000 rpm离心3分钟,取上清液4ul做PCR反应。
阴性质控品:取50μl阴性质控品,加50μl核酸提取液B充分混匀(提取液用前需室温溶解并充分混匀)后100℃10分钟,13,000rpm离心3分钟,取上清液4μl做PCR反应。
BD阳性质控品:直接取4μl进行PCR扩增,或按照PCR扩增介绍方法进行定量分析。
2.PCR扩增
从试剂盒中取出BD-PCR MIX、Taq酶系,室温融化并振荡混匀后,10,000rpm离心10s。
设所需要的PCR反应管管数为N(N=样本数+1管阴性对照+1管阳性对照),每个测试反应体系配制如下表:
试剂    BD-PCR MIX    Taq酶系
用量    24μl    2μl
计算好各试剂的使用量,加入一适当体积洁净离心管中,充分混匀,10,000rpm离心10s,向设定的N个PCR反应管中分别加入26μl,向每管中加入处理后样品或BD-阳性定量标准品(使用前用阴性质控品梯度稀释10倍、100倍、1000倍,记为1×10P6PCopies/ml,1×10P5PCopies/ml,1×10P4PCopies/ml)和阴性质控品4μl,10,000rpm瞬时离心30秒。将各反应管放入定量PCR仪器的反应槽内,按对应顺序设置阴性质控品,阳性定量标准品以及未知标本,并设置反应体积(30μl)、样品名称、标记荧光基团种类(报告基团为FAM,淬灭基团为TAMRA)和循环条件:
ABI PRISM 7700,ABI PRISM5700,ABI GeneAmp 7000 (需要剪掉反应盖),ABI PRISM7300/7500(使用8联管),MJ Opticon(使用8联管)等使用薄壁管的仪器,循环条件:94℃→2分钟,后93℃ 30秒→55℃ 45秒, 40个循环。
LightCycler等使用毛细管的仪器,循环条件:94℃→2分钟,后93℃ 5秒→56℃ 45秒,共40个循环。
3.结果分析判定
反应结束后保存检测数据文件。根据分析后图像调节baseline的start值(3~8),stop值(13~18)以及Threshold值,使Std curve 窗口下的标准曲线达到zui佳(correlation数值介于-0.97~-1之间,correlation数值等同于∣r∣值),zui后到Reporter窗口下记录仪器自动分析计算出的未知标本数值(Qty-Copies/ml)。


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