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Pichia酵母表达直接PCR鉴定重组子的方法

2019.8.08

模板的处理:
1.平板上的菌落长到肉眼可见时(约12小时);
2.将除了模板之外的其它PCR反应液的组分准备好,并分装。引物最好使用Kit中已有的检测专用的引物,或者一条使用载体上的引物,一条使用基因的特异性引物(这样做可以鉴定非定向克隆的方向);
3.用半根灭菌的牙签(节约,而且好用)挑取菌落,在PCR管中涮以下,放入一个灭菌的1.5毫升离心管,对PCR管和1.5毫升离心管编号;
4.PCR扩增,1% 琼脂糖凝胶电泳;
5.对于PCR扩增显现特异性条带的克隆,把置于1.5毫升离心管中的半截牙签扔到5毫升YPDZ培养基中,30度培养,8-12小时后提质粒,酶切鉴定确认。 
PCR反应体系:
以TaKaRa Taq DNA聚合酶反应为例,引物为5´ AOX1 primer,3´AOX primer:
组分  20μl体系
10xReaction Buffer  2.0μl
dNTP  1.6μl
Primer 1(20pmol/L)  0.5μl
Primer 2(20pmol/L)  0.5μl
ddH2O  15.2μl
Taq DNA聚合酶  0.2μl
TOTAL  20.0μl

3.5.3 PCR反应条件:
初始变性  94℃ 4min  1
变性  94℃ 30s  30个循环
退火  50~54℃ 30s  
延伸  72℃ 30s  
结束延伸  72℃ 10min  1
保存  4℃  1
如果筛选的是Mut+,将会出现两条带,一个是目的基因,另一个是2.2kb的AOX1基因,空质粒会出现以下条带(pPICZαA 588 bp),将两者的大小加在一起来解释出现的实验结果。
我的结果是空载体的有大约580多的条带,但重组子的PCR只有将近1000bp的条带(我的目的基因是400bp),没有2.2kb的条带。

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