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临床医生怎么发10分以上的SCI

2020.8.25

  医生是一个又要看病,做手术又要熬夜看文献写标书的苦逼职业。Dr.S深感同情,为了帮助将有限的精力主要放在临床上的广大医生同志们能更好的做科研,Dr.S将会陆续的为大家分享一系列近年发表的高分SCI文章,解析其中的思路和套路,看一下优秀的临床科研是怎么做的,今天先从国内发病量第一的肺癌说起。

  今天分享的这篇文章是2017年刚发表的一篇Journal of the National Cancer Institute文章,题目是Association of Uba6-Specific-E2 (USE1) With Lung Tumorigenesis好简单粗暴,真可谓艺高人胆大,因为没有完整的故事和大量的数据是会被审稿人抓小辫子的哟。所以建议各位看官在自己文章写作的时候还是尽量按照“A基因通过B信号通路在C疾病中发挥D功能”的模式来,比较具体,不会被审稿人说题目太宽泛。

  首先作者不知道从哪里找了一个基因USE1(Dr.S小贴士:一般这类新功能基因都是是样本出发高通量筛选出来的或者通过数据库挖掘出来的),发现这个基因的蛋白表达水平在肺癌组织中相对于正常组织显著升高。而且它还有几种突变型蛋白,也是癌组织里显著升高的。但是mRNA水平却变化不大,说明可能有转录后调控参与。

  既然这个基因在肺癌里有临床相关性,那这个基因有没有功能呢?

  把它干扰后细胞的体外增殖和转移能力下降,且体内成瘤能力也下降了。

  再把它给过表达后发现结果完全逆转了,充分说明这个基因在体内外水平都是一个原癌基因。(Dr.S小贴士:其实干扰和过表达都能得到阳性结果还是比较困难的,可能需要多次重复实验不断摸索最佳条件,不过为了发表高分文章还是建议双向验证基因功能)

  如果没有追求的话做到这一步咱也能发文章了,但再咬牙努把力就能发10分的文章了,是不是心动了,那我们下面咋做呢?找互作蛋白啊!

  通过质谱我们发现了什么——CDC20和CDH1啊,明星基因有木有,而且CDC20和CDH1还能够形成APC/C复合物来降解带有D-box的蛋白,巧了,USE1就有D-box结构域。

  一个有趣的故事就这么出现了。如果细胞中USE1发生突变,D-box区域结构改变,那么其不容易被APC/C降解,积累的USE1能够引起细胞异常增殖和侵袭转移,促使肺癌发生。

  美中不足的是作者没有解释野生型USE1高表达引起肺癌细胞异常增殖和侵袭转移的机制,可能要发另一篇文章吧。

  Dr.S解读:

  1. 本文的最大创新点在于作者研究了一个从来没在肺癌里研究过功能的编码基因USE1,首次报道了其在肺癌中的临床相关性和功能。

  2. 有一个新功能基因在手发几分的文章由你说了算,想发高分文章,临床样本数和下游机制探讨少不了。

  3. 做机制其实也有窍门,用高通量方法(芯片或者蛋白质谱)筛选下游通路或者互作蛋白往往事半功倍。

  4. 编码基因研究的好处在于相对于非编码基因,其功能往往更强,做功能实验更容易出阳性结果,一般人我不告诉他。

  根据吉凯基因的经验,从样本出发芯片,测序,质谱方法高通量筛选新功能基因的概率大约在10%左右,想要筛选验证得到一个新功能基因的难度非常大。吉凯基因历经3年,斥资上亿,已完成近6000个肿瘤相关基因的功能学筛选,从中找到明确的肿瘤功能标志基因若干,等待您来寻宝~~~


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