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单体型限制性片段长度多态性的相关介绍

2022.4.21

  不同的多态性切点在一特定人群中出现(+ )的频率不一样。如在一段DNA 中,切点A出现的频率为0.6 (即60 %的人含有该切点,而另外40 %的人在同一位点处不含该切点);而切点B的出现的频率为0.4 。如果这两个多态性切点(A,B)是随机相关的,那么,A、B同时存在(++ )的概率等于每个位点存在频率的乘积,即0.6 ×0.4=0.24, 即24 %的人同时含有A、B两个切点。如果它们是非随机相关的,那么同时存在的可能性将和预期的频率相差较大。这种相关的非随机性称为连锁不平衡。如果多态性切点数目为n ,则可有2的N次方种不同的组合,每种组合称为一种单体型(haplotype ),每种单体型随机相关的预期出现频率为各个位点频率乘积。但是,实践证明多态性切点之间并非随机相关。例如,在β珠蛋白基因簇内多态性切点2 到9 共8 个,理论应有256 种组合,即256 种单体型。但实际上只有3 种单体型,其中在希腊、意大利和亚洲印度人身上βA 染色体(携带正常β-珠蛋白基因的染色体)就占有94 %,而有些理论上的组合在实际上却是不存在的。在理论上,单体型(从切点2 到9 )的频率为0.46 ×0.48 ×0.7 ×0.27 ×0.83 ×0.52 ×0.37 ×0.32=0.0021, 而实际上该单体型的频率为0.64 ,两者相差甚大。这说明各个多态性切点之间是非随机相关的(连锁不平衡)。但也有例外,如切点10(HinfI 切点)与β基因簇各个切点都是连锁平衡的。从单体型与疾病基因的关系的研究发现,某一β-地中海贫血(简称β-地贫)基因在某一人群中与某些单体型存在着强烈的相关性,并且只有少数例外的情况。这样,在该人群中,只要我们确定了某个人的单体型就可以基本上确定该个体是否含有某种突变基因。

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