毛细管胶束电泳色谱仪分离的基础
毛细管胶束电泳色谱仪分离中，把离子型表面活性剂（如十二烷基硫酸钠）加入缓冲液，当其浓度超过临界浓度后形成有一疏水内核、外部带负电的胶束。虽然胶束带负电，但电渗流速度仍大于胶束的迁移速度，故胶束将慢速向负极移动。
中性粒子按其疏水性不同，在缓冲液（流动相）和胶束（准固定相）之间分配。疏水性强、亲水性弱的粒子分配到胶束中的多，分配到缓冲液中的少。反之，亲水性强、疏水性弱的粒子分配到胶束中的少，分配到缓冲液中的多。当粒子进入胶束时，以胶束的速度慢速迁移。当粒子进入缓冲液时，以电渗流速度快速迁移。粒子的分配系数越大，在电泳柱中的迁移速度越慢，从而使疏水性稍有差别的中性物质在电泳中得以分离。
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