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生命的起源到底有哪些必需要素?Cell提出不同的观点

2017.3.06

  生物通报道:波士顿大学的研究学者利用计算机系统生物学方法,调取生物数据库中所有相关信息,开展“生物圈水平新陈代谢”调查,分析得出结论:生命的最初起源很可能与磷酸盐无关。

  对于所有生命系统和现存的大部分已知的生物分子来说,磷酸是必不可少的化学物质。 糖磷酸骨架组成了核酸的结构框架,包括DNA和RNA。 磷酸是三磷酸腺苷(ATP)的一个关键组成部分,负责运输化学能量,以及结合NADH参与几项重要的新陈代谢。

  有关生命起源,有说法称将氨基酸和ATP结合的化学反应是生命形成的关键,这种结合使蛋白质能够自行装配。生命起源与陨石碰撞的理论,暗示着生命体内的磷酸可能源自一种含有磷铁镍的陨石。然而,磷酸基团中的主要成分——磷,虽然大量存在于地壳中(约1015吨)。但大部分是不易溶于水的矿物质形态,而生命起源于水,磷酸根如何进入或源源不断地补充入这淌“水”中的?虽然,火山口处的高温可以将含磷酸盐的矿物转变成可溶性磷酸盐,但至少当代的火山能够释放出来的磷数量很少。

  有人提出,生命早期代谢途径不依赖于磷酸。在磷酸盐出现之前,矿物质表层的铁和硫行驶主要的催化和供能作用。其中一个比较著名的生命起源理论称,早期ATP的角色是由硫酯来扮演的。硫酯同样广泛存在于蛋白质、碳水化合物、和脂质代谢。然而,我们无法探知在地球早期阶段,铁和硫的有效性,因此,缺乏确凿的证据来支持这些理论。

  目前我们尚不清楚,生命的初始阶段,磷酸是否就已经成为了如此重要的生命组成要素。美国波士顿大学的研究人员,利用系统生物学的方法探讨了这一长期存在的难题。令人信服的、数据驱动的证据表明,原始的生命形式很可能并不依赖于磷酸。

  计算机系统生物学最初是用来大规模分析代谢网络,利用大型数据库来组装现有的生化反应。在生态系统水平探测了“生物圈水平的新陈代谢(biosphere-level metabolism)”后,研究人员发现了一组8个很可能在生命起源早期就出现了的不含磷酸的复合体。随后,他们通过算法编辑,将这8个复合体可能替代的所有合成反应,包括甲酸、硫化氢、氨、二氧化碳、水、碳酸氢铵、氮气,组装起来,模拟了原始的新陈代谢网络。该网络涉及315步反应,以及260个代谢产物,可以支持广泛种类的生命要素的生物合成,例如氨基酸和羟基酸。值得注意的是,这一网络中所富含的酶类,含有成簇的铁-硫基团。支持了“现代生物化学源自矿物地球化学”这一观点。更重要的是,在现实的生理学条件下,这个代谢网络中的硫酯代替了磷酸盐,可能使其克服了能量瓶颈而不断扩张。

  这一分析表明,一些简单的早期化合物可以维持生命物质的生存繁衍,直到出现丰富的磷酸盐代谢网络。曾经也有学者提出在磷酸盐出现以前,存在早期硫基生物化学,但并没有数据证据仅是一些彼此分散的反应。如今,Segrè等人的研究为我们提供了一个完整度,相关度,以及丰富程度极高的早期新陈代谢网络图。

  尽管这项缺乏实验证据的纯理论计算,并不能决定性地证明“生命早期代谢途径不依赖于磷酸”这一个理论,但它为“铁-硫假说”和“硫酯假说”提供了关键的数据支持。同时,也质疑了“RNA起源理论”(能够自我复制的RNA是所有地球生物最初的形态)。相反,支持了“代谢起源假设”(假设自持存活的非磷酸代谢网络早于核酸的出现)。换句话说,核酸可能是早期进化过程的产物,而不是先决条件。

  本文的第一作者,波士顿大学的Joshua Goldford称,如果早期的新陈代谢不一定需要磷酸盐的话,那么磷酸可能不是细胞产生的必要因素。原始的新陈代谢系统需要一个能量源,或者来自地球表面,比如太阳能,或者来自深海热泉(原理和火山喷发类似)。在未来的研究中,科学家们将继续应用系统生物学的方法来研究生命的起源。

  现代科学实验不断验证了古籍中的理论,比如生物通在2月24日编译的一篇发表在当天Cell的文章,为中医的饥饿疗法提供了分子生物学的论证;中医古籍记载的青蒿素更是获得了诺贝尔奖。不禁让人联想,本文中提到的观点也部分印证了圣经中的预言——生命从泥土而来。泥土的主要成分的确不包含磷酸盐。相信如果我们能虚心的学习,细心论证,在古籍中取其精华,去其糟粕,定能在现代科学研究中大放异彩。

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