免疫传感器可以用来进行DNA分子的识别、测序。其原理是将有反应性的一单股核苷酸(长度在18～50 个碱基之间)固定在某种支持物(传感器)上作为探针，可以在复杂环境成份下特异地识别出某一靶子底物 ，并通过换能装置转换成可以检测到的光电信号。

检测的方法有荧光型和表面等离子体共振(SPR)型传感器。荧光检测法是在 DNA 探针中或待测靶基因中标上荧光标记物 ，也可在 DNA 杂交后加入荧光标记物。通过测定荧光标记嵌入 DNA 双螺旋间所导致的荧光信号的变化，检测 DNA. Krull 等以共价固定在石英表面的DNA探针与溶液中其靶基因杂交45min后，与荧光嵌入染料溴乙啶( EB)反应 ，根据荧光强度与溶中互补 DNA 的量的正比关系进行分析，可检测出86 μg/L 的 DNA. Bier 等以花青二聚体 YOYO 及Picogreen作为与 DNA 双链紧密亲和的荧光嵌入剂，由于与DNA杂交体间的双嵌入作用，使得完全配对、单碱基错配及两个以上不匹配所产生的荧光信号有明显不同，从而能够明显区分不同DNA序列。还可以用表面等离子体共振传感器检测 DNA 序列 ,Bier 等做了这样的工作。