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蛋白质组学之逆袭:深度注释基因组(三)

2020.5.25

人类尚未充分认识复杂的癌症基因组是如何转化为导致复发和死亡的驱动生物学的,将蛋白质组学与基因组学结合在一起能够让我们获得对癌症的新认识,同时提供一种有价值的资源以便科学界能够用来提出关于这些疾病的新假设,以及治疗它的手段。蛋白质基因组学终有一天会被证明是一种强大的临床工具,使得人类能够横跨癌症基因组学与临床效应之间巨大的知识鸿沟。

以上两个案例中,蛋白质组学都使用了他独门绝技串联质谱技术中关键的一招——iTRAQ(这一招杀伤力极大,前面已作介绍,在此无需赘言),在此利用iTRAQ获得强大的蛋白质组数据完成了对基因组更深层次的注释。关于蛋白质基因组学夫妇的事迹就先介绍到这,但是他们的故事远未结束,相信在他们的紧密合作之下,还会不断碰撞出新的火花,比如说我们可以将基因组学中的测序或芯片数据与iTRAQ得到的蛋白质组学数据结合起来进行跨组学关联分析(具体的分析方法并不难,可以私信黄博深入讨论),从而获得表达谱的全景图,实现其间的互补和整合,对生物体特定状态下的基因和蛋白质表达水平进行全方位分析;并且在全局上获得对差异表达谱的广泛理解,挖掘受转录后调控的关键蛋白/基因,寻找验证某些重要的生物学调控;另外,对于一些蛋白数据库尚不完善的物种,通过转录组数据构建蛋白质序列数据库,提高蛋白质组学实验中蛋白质的鉴定数目。


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