原料污染

食品原料在采集和加工前期，表面上往往附着很多细菌，特别是表面破损的水果、蔬菜、肉类和水产品。

烹调用具和餐具污染

加工污染

加工食品多是包装食品，一般较为清洁，但也会受到二次污染。当厨房卫生条件不良时，空气中漂浮的细菌会沉降到食品表面；在烹调加工过程中，如果不注意生熟分开，细菌就会从生鲜食品或半成品上转移到熟食上，造成食品的交叉污染；食品烹调加工人员如果不注意个人卫生或患有传染性疾病，通过其手、衣服、呼吸道、头发等，可直接或间接地造成食品的细菌污染；烹调加工中使用的调味品（如酱油）和水如果含有细菌，也能造成食品的细菌污染。

储藏污染

不良的储藏环境会使残留在食品中的细菌生长繁殖，并通过空气、鼠或昆虫污染食品。过分相信冰箱，使食品在冰箱中的存放时间过长，也能使食品的细菌数量上升。

烹调用具和餐具污染

食品从购买到食用的这一段时间内，可因烹调用具生熟不分、不清洁或未洗手就进餐等造成食品污染。