反义RNA的作用机制

反义RNA的分类和作用机制：下表总结了原核细胞内天然存在的11种反义RNA。这些反义RNA按其作用机制可经分为三大类。

调节水平 反义RNA 靶RNA 分类 功能 来源

转录后水平 micF RNA ompF mRNA 1A OmpF合成 染色体

oop RNA cⅡmRNA 1B 溶菌-溶源 噬菌体

sar RNA antmRNA 1A 溶菌-溶源 噬菌体

ouT RNA 转位酶mRNA ⅠA 转位作用 转位子

finp RNA traJ mRNA ⅠA DNA转位

sok RNA hok mRNA ⅠA 杀死作用

copA RNA repA mRNA Ⅱ 复制 质粒

R1162RNA repⅠmRNA Ⅱ 复制

pT181RNA repC mRNA Ⅱ 复制

转录水平 ticRNA CAP mRNA Ⅲ cAMP结合蛋白 染色体

复制前水平 RNAⅠ RNAⅡ Ⅲ DNA复制 质粒

Ⅰ类:这类反义RNA直接作用于其靶mRNA的SD序列和/或编码区，引起翻译的直接抑制(ⅠA类)或与靶mRNA结合后引起该双链RNA分子对RNA酶Ⅲ的敏感性增加，使其降解(ⅠB类)。Ⅱ类:这类反义RNA与mRNA的SD序列的上游非编码区结合，从而抑制靶mRNA的翻译功能。其作用机制尚不完全清楚，可能是反义RNA与靶mRNA的上游序列结合后会引起核糖体结合位点区域的二级结构发生改变，因而阻止了核糖体的结合。Ⅲ类:这类反义RNA可直接抑制靶mRNA的转录。

ticRNA(transcription inhibitory complementary RNA)是大肠杆菌中CAP蛋白(cAMP结合蛋白)的mRNA的反义RNA。ticRNA的基因的启动子可被cAMP-CAP复合物所激活，从CAP mRNA的转录起始位点上游3个核苷酸处开始，以CAP mRNA的模板DNA链的互补链为模板，合成ticRNA。ticRNA具体长度不清楚，但是它是5'端一段正好和CAP mRNA的5'端有不完全的互补，可以形成双链的RNA杂交体。而在CAP mRNA上紧随杂交区之后的是一段约长11bp的A，U丰富区。这样的结构十分类似于ρ不依赖性的转录终止子的结构，从而CAP mRNA的转录刚刚开始不久后即迅速终止。从这个例子中我们可以看到CAP蛋白合成的自我调节作用。当CAP合成达一定量后，即可与cAMP结合成cAMP-CAP复合物。再激活ticRNA的启动子转录出ticRNA，反过来抑制CAP-mRNA的合成。