2009年度国家自然科学奖名单公布
2010年1月11日，2009年度国家科学技术奖励大会在人民大会堂隆重举行，大会颁布了国家最高科学技术奖、国家技术发明奖、国家科技进步奖等重要奖项。其中，国家自然科学奖28项，与科学仪器紧密相关的有3项，详细如下(标红色字体的为与科学仪器紧密相关的奖项)：
一等奖
| 序号 | 编号 | 项目名称 | 主要完成人 | 推荐单位 |
| 1 | Z-105-1-01 | 《中国植物志》的编研 | 钱崇澍（中国科学院植物研究所）陈焕镛（中国科学院华南植物园）吴征镒（中国科学院昆明植物研究所）王文采（中国科学院植物研究所）李锡文（中国科学院昆明植物研究所）胡启明（中国科学院华南植物园）陈艺林（中国科学院植物研究所）陈心启（中国科学院植物研究所）崔鸿宾（中国科学院植物研究所）张宏达（中山大学） | 中国科学院 |
二等奖
| 序号 | 编号 | 项目名称 | 主要完成人 | 推荐位 |
| 1 | Z-101-2-01 | 湍流热对流的实验研究 | 夏克青（香港中文大学） | 专家推荐 |
| 2 | Z-101-2-02 | 非线性偏微分方程的自适应与多尺度计算方法 | 陈志明（中国科学院数学与系统科学研究院） | 中国科学院 |
| 3 | Z-101-2-03 | 堆积理论中若干问题的研究 | 宗传明（北京大学） | 专家推荐 |
| 4 | Z-102-2-01 | 半导体低维结构光学与输运特性 | 李树深（中国科学院半导体研究所）孙宝权（中国科学院半导体研究所）李新奇（中国科学院半导体研究所）江德生（中国科学院半导体研究所）夏建白（中国科学院半导体研究所） | 中国科学院 |
| 5 | Z-102-2-02 | 太阳磁场结构和演化研究 | 汪景琇（中国科学院国家天文台） | 专家推荐 |
| 6 | Z-102-2-03 | 非线性科学在心颤机理及系统生物学中细胞周期控制上的应用研究 | 欧阳颀（北京大学）王宏利（北京大学）周路群（北京大学）李方廷（北京大学） | 北京市 |
| 7 | Z-102-2-04 | 过渡族金属氧(硫)化物的电磁行为研究 | 张裕恒（中国科学技术大学）孙玉平（中国科学院固体物理研究所）杨昭荣（中国科学技术大学）谭舜（中国科学技术大学）戴建明（中国科学院固体物理研究所） | 中国科学院 |
| 8 | Z-103-2-01 | 基于组合方法与组装策略的新型手性催化剂研究 | 丁奎岭（中国科学院上海有机化学研究所）袁宇（中国科学院上海有机化学研究所）王兴旺（中国科学院上海有机化学研究所）龙江（中国科学院上海有机化学研究所）刘（中国科学院上海有机化学研究所） | 上海市 |
| 9 | Z-103-2-02 | 若干手性催化合成方法学及其在多肽研究中的应用 | 王锐（兰州大学）许兆青（兰州大学）杨晓武（兰州大学） | 甘肃省 |
| 10 | Z-103-2-03 | 超支化聚合物的可控制备及自组装 | 颜德岳（上海交通大学）周永丰（上海交通大学）高超（上海交通大学）朱新远（上海交通大学）周志平（上海交通大学） | 上海市 |
| 11 | Z-103-2-04 | 电化学发光及其毛细管电泳联用的分析方法研究 | 汪尔康（中国科学院长春应用化学研究所） 董绍俊（中国科学院长春应用化学研究所） 杨秀荣（中国科学院长春应用化学研究所） 徐国宝（中国科学院长春应用化学研究所） 由天艳（中国科学院长春应用化学研究所） | 中国科学院 |
| 12 | Z-103-2-05 | 多相体系的化学反应工程和反应器的基础研究及应用 | 毛在砂（中国科学院过程工程研究所）陈家镛（中国科学院过程工程研究所）杨超（中国科学院过程工程研究所）王跃发（中国科学院过程工程研究所） | 专家推荐 |
| 13 | Z-104-2-01 | 大别山－苏鲁大陆深俯冲及其对华北克拉通的影响 | 叶凯（中国科学院地质与地球物理研究所）张宏福（中国科学院地质与地球物理研究所）王清晨（中国科学院地质与地球物理研究所）杨建军（中国科学院地质与地球物理研究所）刘景波（中国科学院地质与地球物理研究所） | 中国科学院 |
| 14 | Z-104-2-02 | 大气颗粒物及其前体物排放与复合污染特征 | 贺克斌（清华大学）郝吉明（清华大学）段凤魁（清华大学）陈泽强（香港科技大学）杨复沫（清华大学） | 教育部 |
| 15 | Z-104-2-03 | 土壤-植物系统典型污染物迁移转化机制与控制原理 | 朱永官（中国科学院生态环境研究中心）王子健（中国科学院生态环境研究中心）张淑贞（中国科学院生态环境研究中心）王春霞（中国科学院生态环境研究中心）陈保冬（中国科学院生态环境研究中心） | 中国科学院 |
| 16 | Z-105-2-01 | 若干重要药用植物的成分研究 | 谭仁祥（南京大学）郑荣梁（兰州大学）贾忠建（兰州大学）孔令东（南京大学）郑汉其（香港中文大学） | 教育部 |
| 17 | Z-106-2-01 | 血压波动性和器官损伤的研究 | 苏定冯（第二军医大学）缪朝玉（第二军医大学）沈甫明（第二军医大学）谢和辉（第二军医大学）刘建国（第二军医大学） | 上海市 |
| 18 | Z-106-2-02 | 拓扑异构酶II新型抑制剂沙尔威辛的抗肿瘤分子机制 | 丁健（中国科学院上海药物研究所）缪泽鸿（中国科学院上海药物研究所）蒙凌华（中国科学院上海药物研究所）张金生（中国科学院上海药物研究所）卿晨（中国科学院上海药物研究所） | 上海市 |
| 19 | Z-107-2-01 | 微器件光学及其相关现象的研究 | 吴颖（华中科技大学）杨晓雪（华中科技大学） | 湖北省 |
| 20 | Z-107-2-02 | 盲信号的分离和辨识理论及其应用 | 谢胜利（华南理工大学）李远清（华南理工大学）谭洪舟（中山大学）谭营（北京大学）何昭水（华南理工大学） | 教育部 |
| 21 | Z-107-2-03 | 离散事件动态系统的优化理论与方法 | 曹希仁（香港科技大学）赵千川（清华大学）陈曦（清华大学）贾庆山（清华大学） | 香港特别行政区 |
| 22 | Z-107-2-04 | 特征抽取理论与算法研究 | 杨静宇（南京理工大学）杨健（南京理工大学）金忠（南京理工大学）洪子泉（南京理工大学） | 江苏省 |
| 23 | Z-108-2-01 | 新概念有机电致发光材料 | 马於光（吉林大学）王悦（吉林大学）沈家骢（吉林大学） | 教育部 |
| 24 | Z-108-2-02 | 有机高分子发光材料及其在显示器件中的应用 | 王利祥（中国科学院长春应用化学研究所） 马东阁（中国科学院长春应用化学研究所） 耿延候（中国科学院长春应用化学研究所） 景遐斌（中国科学院长春应用化学研究所） 王佛松（中国科学院长春应用化学研究所） | 吉林省 |
| 25 | Z-109-2-01 | 红外热辐射光谱特性与传输机理研究 | 谈和平（哈尔滨工业大学） 刘林华（哈尔滨工业大学） 夏新林（哈尔滨工业大学） 阮立明（哈尔滨工业大学） 余其铮（哈尔滨工业大学） | 黑龙江省 |
| 26 | Z-109-2-02 | 能源动力系统中能的综合梯级利用和CO2控制原理与方法 | 金红光（中国科学院工程热物理研究所）蔡睿贤（中国科学院工程热物理研究所）林汝谋（中国科学院工程热物理研究所）张娜（中国科学院工程热物理研究所）高林（中国科学院工程热物理研究所） | 中国科学院 |
| 27 | Z-109-2-03 | 复杂防洪调度系统的多目标决策及径流预报理论 | 程春田（大连理工大学）李登峰（海军大连舰艇学院）周国荣（香港理工大学） | 辽宁省 |
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