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兔单克隆抗体kappa轻链CDR3长度异质性

2022.12.21

抗体多样性是由多个不同基因片段——可变(V)、连接(J)、多样性(D)、轻链(L)和重链(H)-VL、JL和VH、D、JH的组合关联产生的,并通过3~4种不同的机制进行体细胞放大。小鼠和人类的κ系统由50-100个Vκ片段组成和4~5个功能性Jκ片段组成,位于单个Cκ基因5'端2.5kb处。第三高变区(CDR3)是抗体结合位点的一部分,在人和小鼠κ链中通常有9个氨基酸长。它由Vκ片段的最后7个密码子和Jκ片段的前两个密码子编码,有时在V和J之间通过连接变化添加或删除一个密码子。在兔子中,编码主要同种型的Cκ1基因与5个Jκ片段相关(其中似乎只有一个有功能),组合潜力显着降低。然而,兔CDR3长度存在的广泛异质性,类似于重链中的D片段。兔Vκ基因3'端有几个额外的核苷酸。因此,即使只有一个功能性Jκ区段,基于Vκ种系片段长度的异质性和它们较长的长度,也可以产生较高的CDR3多样性,这也为增加连接缺失创造了机会。

 

在兔子、小鼠和人中与Vκ-Jκ连接相关的信号序列完全相同,但可能是由于Jκ和Vκ长度的结构约束,兔子选择了与重链系统类似的缺失机制。先前这种连接缺失主要在VH-D和D-JH连接上发现,鲜少出现在轻链系统。兔子Vκ片段和Jκ片段重组会删除Vκ/Jκ片段上的核苷酸。在重组过程中,连接缺失或变化必须遵循链切割。兔子Vκ基因3`端额外的核苷酸与重链的D片段完全相同,它们可以在重排期间增加连接缺失机制,进而增加CDR3的多样性。这与小鼠和人通过Vκ基因核苷酸缺失的物种进化机制一致。人的λ链也表现出CDR3长度异质性,也许兔的Vκ基因与人的Vλ同源。

 

免疫球蛋白基因片段可以在不同程度上使用产生抗体多样性的机制,人和小鼠的κ轻链CDR3多样性是基于组合潜力,通过有限连接变化机制放大。兔子只有单功能的Jκ片段,多样性是基于Vκ-CDR3胚系区较长的长度和长度异质性。通过V-J重组期间Jκ和Vκ的核苷酸缺失来进一步放大多样性。兔k轻链的多样性模拟了人类和小鼠重链系统中CDR3多样性的机制,CDR3在VH段3`端高度保守,其通过D片段、N区和连接缺失事件来实现长度和序列的异质性。

 

参考文献

Heidmann O, Rougeon F. Immunoglobulin kappa light-chain diversity in rabbit is based on the 3' length heterogeneity of germ-line variable genes[J]. Nature, 1984, 311(5981): 74-6. 

 


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