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DNA(基因)检测-Southern Blot

2019.4.30

DNA(基因)检测-Southern Blot

DNA吸印转移

1.室温下将电泳后的琼脂糖凝胶浸入500ml溶液A中,摇动30分钟后换500ml新鲜溶液A再摇30分钟,使DNA双链碱变性。

溶液A

5M NaCl     300.0ml

10M NaOH    50.0ml

H2O         650.0ml

2.为使凝胶重新回到中性,换入溶液B中重复上述1过程。

溶液B

10M 乙酸铵      200.0ml

10M NaOH         4.0ml

H2O            1796.1ml

硝酸纤维素薄膜(NC膜)

3.料盒或盘中放一玻璃板支架,倒入10×SSC,将Whatman 3MM滤纸放在玻璃板上,两头浸在液体中,用玻棒赶除气泡。

4.心地将琼脂糖凝胶翻过(扣过来)滑到纸上,放平、赶除气泡。

5.将预先浸于溶液B中的NC膜,平铺在胶上,用玻棒赶除气泡。

6.在膜上放置两层预先以10×SSC浸湿的Whatman 3MM滤纸。

7.再放6张干燥吸水纸及475px厚的折叠吸水纸。

8.在纸上覆盖玻璃平板,板上可置约250g重物,下部缓冲液根据虹吸原理能被吸上来,凝胶上的单链DNA即可被吸出并转移到NC膜上。转移速度取决于DNA片段的大小。<1kb的片段在0.7%的胶中2小时即可转出,而15kb的片段需15小时以上,一般维持1224小时。

9.转移完成后,将胶与膜取出,通过样品槽、表明记号,并剪去膜的一角,以识别方向,此时膜与胶正面观察的方向是一致的。

10.  去掉胶,令膜稍加干燥,用圆珠笔标号。

11.  如为硝酸纤维素膜,则用3MM滤膜包好,80℃烘烤2小时。若为尼龙膜则用紫外等照10分钟,使DNA牢固地结合于膜上,即可用于分子杂交。

12.  将膜在6×SSC中浸泡几分钟,放入塑料袋,按0.2ml/cm2膜面积加入预杂交液,排净气泡封闭袋口,在68℃水浴中振动预杂交24小时。

13.  取出塑料袋,在一角切一缺口,倒出预杂交液,按50μl/cm2膜面积加入杂交液,排净气泡、封口,再于68℃水浴中振动杂交,一般来源于真核细胞的总DNA,需杂交1216小时。

14.  杂交结束后取出塑料袋,剪开边缘,迅速将膜转到2×SSC0.5EDTA溶液中室温下洗涤(振荡)5分钟,再将膜转移人2×SSC0.1SDS溶液中洗涤15min,然后将膜浸入0.1SSC0.5SDS溶液中68℃振荡洗涤2小时,换同样溶液再洗涤30分钟。

15.  取出滤膜在Whatman滤纸上晾干,放入塑料袋或用塑料纸包好,在暗室中将X光片与滤膜接触,封于曝光夹中,进行放射自显影115天。

16.  X光片被取出。常规显定影后显示杂交情况,如曝光时间不够可重新放入X光片再次曝光,直到带型显示清晰。


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