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蛋白质内序列分析用肽段的分离与纯化实验

2020.8.17

试剂、试剂盒 考马斯亮蓝 G乙酸甲醇Achromobacter 胰蛋白酶 I 三氟乙酸乙腈2-丙醇

仪器、耗材 SpeedVac 型旋转浓缩器Tween-20UltrafreeTM MC 滤器C18 反相 HPLC 柱

实验步骤

材料与设备


考马斯亮蓝 G(0.05% 的乙酸-20% 甲醇溶液)


乙酸 (5% 的 10% 甲醇溶液)


甲醇 (50% 的水溶液和 10% 的水溶液)


SpeedVac 型旋转浓缩器(Savant Instruments,Inc.)


Achromobacter 胰蛋白酶 I〔赖氨酰内肽酶;50ng/ul 的 0.1mol/LTri-HCl(pH9.0)〕


Tween-20〔0.1% 的 0.1mol/L Tris-HCl(pH9.0) 溶液〕


UltrafreeTM MC 滤器(22um;Millipore Corp.)


三氟乙酸(TFA;0.1% 的 50% 乙腈溶液)


C18 反相 HPLC 柱 (2.1X250 mm;5um,300A)(VYDAC)


乙腈


2-丙醇


操作程序


1) 用 SDS-PAGE 分离待研究蛋白。


2) 凝胶用 0.05% 考马斯亮蓝 G 染色 15~30 min。


3) 用含 5% 乙酸的 10% 甲醇溶液脱色。


4) 在水中浸泡 10 min。


5) 从凝胶上切下蛋白带,转移至微量离心管。切下一段不含蛋白质的凝胶作对照。如必要,可将凝胶切成较小的碎片,使之能容易地沉入微量离心管的底 部。


6) 各管加入 1 ml 50% 甲醇。室温下孵育 20 min。弃上清。


7) 各管加入1ml 10% 甲醇。室温下孵育 20 min。弃上清。


8) 凝胶碎片在 SpeedVac 型旋转浓缩器中干燥 2 min。


9) 各管加 10ul Achromobacter 蛋白酶 I。


10) 各管加最小体积的含 0.1%Tween-20 的 0.1mol/L Tris-HCl(pH9.0)—刚够淹没凝胶碎片即可。

注:凝胶碎片会膨胀, 故重要的是要保证它们仍能淹没在含去垢剂的缓冲液中。


11) 各管 30℃ 孵育 24 小时。


12) 各管在微量离心机中离心,将各管上清转移至 22-um Ultrafree MC 滤器内。12000r/min 离心 2 min。保留滤液。


13) 加 1 体积含 0.1%TFA 的 50% 乙腈溶液于各管留下的凝胶碎片中--足够淹没凝胶碎片。4°C 孵育 30 min。


14) 重复第 12、13 步操作。合并各样品的滤液。


15) 样品在 SpeedVac 型旋转浓缩器中旋转浓缩至体积小于 100 ml。加适量 HPLC 平衡液,制成供 HPLC 分析用的样品。


16) 用反相 HPLC C18 柱分离消化液中的肽段。用含 0.09% TFA 的乙腈/2-丙醇 (3:1) 梯度洗脱肽段。于 214mn(对肽键)和 295nm(对色氨酸)检测肽段的 UV 吸收。


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