关于丙酮酸脱氢酶复合体的反应过程介绍
在复合物内进行的脱羧作用主要可分为5个步骤，丙酮酸与乙酰辅酶A的中间物在复合物理的移动过程，大致依照E1、E2的顺序，E3则没有直接与中间物接触。其中丙酮酸是在第一个步骤（E1中）加入反应，乙醘辅酶A是在第三个步骤（E2中）中生成。
在第一个步骤中，丙酮酸上的一号碳（C-1）与相连的两个氧原子，会形成二氧化碳然后释出；C-2则会与E1中的TPP结合形成羟乙基TPP（Hydroxyethyl TPP），对丙酮酸来说是个氧化反应。这个步骤是所有步骤中最慢的一个，因此决定了整个反应的速率。
接下来TPP会将羟乙基带入第二个步骤，TPP本身则留在E1中继续作用。羟乙基氧化之后变成乙酸基，并进入E2，与硫辛酰基上的其中一个硫原子结合，已经氧化过的硫辛酰基离胺酸与乙酸基结合，成为酰基硫辛酰基离胺酸（Acyl lipoyllysine）。
第三个步骤在E2进行，酰基硫辛酰基离胺酸会与辅酶A进行反应，此反应会使硫辛酰基离胺酸还原，并释出乙酰辅酶A。硫辛酰基离胺酸则经过下一步骤的氧化之后回到第二步骤作反应。
第四个步骤中，E3的辅成基FAD会使上一步骤中还原的硫辛酰基离胺酸再度氧化，以回到第二步骤；而FAD经过反应之后，会变成FADH2。
最后FADH2与NAD+反应而氧化成FAD，回到第四步骤。NAD+则还原成NADH，并且放出一个氢离子。
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