利用人体微生物制药，这可能吗？
人体内共生的微生物能够生产天然药物，这些药物对维持人体健康起到了重要的作用，论文资深作者、UCSF助理教授Michael Fischbach 说。 Fischbach 说：“现在市面上的药物都是制药公司生产的，但我们现在知道，人体菌群也能生成同样有效的药物分子。”
Fischbach 介绍到，目前临床上三分之一的药物来自于微生物和植物，包括青霉素等抗生素、化疗药物和降胆固醇的药物。人们不断在土壤和海洋微生物中挖掘新药，却从未意识到我们自己就是一个“炼丹炉”。
人类微生物组计划一直在研究常驻在人体各处的不同菌群，解析微生物多样性和丰度与疾病之间的联系。实际上，这些细菌合成的小分子也很重要，它们控制着细菌和宿主之间的互作，只可惜这类研究还没有跟上进度。 Fischbach 等人开发了数据分析软件ClusterFinder，依据土壤和海洋微生物的生物合成基因簇（BGC），系统分析了人类微生物组计划的遗传学数据库。他们在人体不同位置的菌群中，鉴定了3,118个生物合成基因簇。这些基因簇编码的酶，可以合成类似现有药物的分子。
研究显示，在人体菌群的基因组和宏基因组中，广泛存在着编码硫肽类抗生素（thiopeptide）的BGC。研究人员纯化了共生菌Lactobacillus gasseri生产的硫肽，将其命名为lactocillin，并且解析了它的结构。他们发现，lactocillin的结构与一些已经通过临床试验的抗生素很相似，能杀死一些革兰氏阳性致病菌，同时又无损于那些无害的细菌。宏转录组测序数据表明，lactocillin等硫肽BGC的确在体内得到了表达。
这项研究告诉我们，人类微生组中广泛存在着编码小分子的BGC。这些与人类共生的细菌，能在我们体内生产大量类似药物的小分子。 “我们需要了解这些分子是什么，有什么功能，” Fischbach 说。“这将为新药开发提供的非常诱人的资源。”此外，人们也可以在此基础上，从分子水平研究微生物组对人体的影响。
研究已经证实，微生物的构成——即生活在人体内的细菌——对健康会产生巨大影响，但科学家尚不清楚这些微生物的工作机理。
Fischbach的团队提纯出了其中一种药物：由阴道细菌生产的thiopeptides。研究人员发现，这种药物和其他thiopeptides一样，能杀死相同类型的细菌，例如金黄色酿脓葡萄球菌（能导致皮肤感染）。
克雷格·文特尔研究所微生物基因学家Derrick Fouts表示，找到特定的分子并研究其作用将帮助研究者了解微生物和人体的相互作用方式。 Fouts说：“新研究让我们感受到生物信息学的巨大威力——不仅能从大数据中识别出特定的基因，还能将这些基因联系起来，从而解开与人类共生的细菌是如何维持人体健康的谜团。”
其他研究者表示，该研究还为如何利用微生物开发新药提供了线索。科学家一直在争论，生活在人体内的微生物是否是一个丰富的药物来源。很多制药公司正在试图借用这一理念。
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