细胞外囊泡中富含lncRNA编码多肽/小蛋白且有疾病特异性
lncRNAs是一类长度大于200个碱基且不编码蛋白的RNAs转录本。近年来，越来越多实验证据表明，许多lncRNAs转录本中的小开放阅读框（small open reading frame，smORFs）可以编码多肽/小蛋白（smORF encoded polypeptides or microproteins），并在细胞Ca2+稳态、代谢和发育、应激信号传导和DNA修复等重要生物学过程中发挥不同的调节作用。有研究发现，与癌症相关的lncRNA及其编码的功能性多肽/小蛋白能够影响肿瘤的发生、侵袭和转移。然而，lncRNA编码多肽/小蛋白在癌症发生、发展中的作用机制仍未得到深入表征，尤其是其可能的作用机制和模式有待进一步探讨。
7月12日，中国科学院生物物理研究所研究员杨福全团队、中科院院士陈润生团队及北京三博脑科医院教授张宏伟团队在Journal of Extracellular Vesicles上，在线发表了题为LncRNA-encoded microproteins: A new form of cargo in cell culture-derived and circulating extracellular vesicles的研究论文，首次报道了lncRNA编码多肽/小蛋白是一种新的细胞外囊泡内容物。进一步的实验数据显示，血浆EVs中富含lncRNA编码多肽/小蛋白，其组成的差异可用于区分脑胶质瘤患和健康对照。
研究人员利用基于生物质谱的高灵敏、高通量lncRNA编码多肽/小蛋白的发现与鉴定技术平台，分别从脑胶质瘤细胞系及其衍生的EVs中发现了84和29种lncRNA编码多肽/小蛋白，并借助核糖体分离技术和RT-PCR技术，质粒构建及体外表达、免疫印迹和免疫荧光以及免疫共沉淀等多种实验手段，进一步验证了鉴定结果的可靠性，证实lncRNA编码多肽/小蛋白是一种新的细胞外囊泡内容物。基于此，研究人员从全血浆、去除EVs的血浆以及血浆来源的EVs中分别鉴定出3、11和48种lncRNA编码多肽/小蛋白，表明循环的lncRNA编码多肽/小蛋白主要富集在血浆EVs中。进一步结合临床样本发现，血浆EVs lncRNA编码多肽/小蛋白的组成差异可用于区分脑胶质瘤患者和健康对照，具有潜在的临床应用价值。
研究工作得到国家重点研发计划和国家自然科学基金重大研究计划"基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制"培育项目等的资助。
基于质谱技术的lncRNA编码多肽/小蛋白鉴定工作流程
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