卫星DNA的基本系统特点介绍

多态性和保守性

卫星DNA具有多态性和保守性，卫星位点由微卫星的核心序列与其两侧的侧翼序列构成，侧翼序列使某一卫星特异地定位于染色体的某一部位，而卫星本身的重复单位变异则是形成微卫星多态性的基础。在某一个体基因组中两条同源染色体的相对（侧翼序列相同）位置上如两侧翼序列间所包含的卫星重复单位数相同与不同，则分别表现为纯合基因型和杂合基因型。卫星DNA的保守性表现在哺乳动物之间，特别是一些紧密相关的物种如牛与羊、马属动物之间以及鸡与火鸡之间具有一定程度的保守性。Moore等（1995）用牛的卫星引物分别在羊、马及人的基因组中进行扩增发现，在羊中56%的引物可扩增出特异产物，其中42%的扩增产物表现出多态性；而在马及人中未扩增出多态产物。Levin等（1995）用48个鸡微卫星位点的引物，以火鸡的基因组DNA进行扩增发现：92%的引物可扩增出产物，33%的扩增产物经鉴定是与鸡同样的微卫星，其中28%的产物表现出多态性。由于卫星DNA引物在物种间的通用性，使得物种如牛、绵羊、山羊之间引物的互用成为可能。Gortari等（1997）研究表明；58%的牛引物可以在绵羊中扩增出特异产物且40%的扩增产物表现出多态性。Vaiman等（1996）的研究同样表明34%的牛引物以及绵羊引物在山羊中呈多态且其发表的第一个公山羊遗传图谱中的219卫星标记中，有45个来自绵羊卫星，164个来自牛卫星。Schibler等（1998）在人的遗传图谱中寻找到了43个牛和绵羊的卫星及34个山羊卫星。许多研究结果表明反刍动物中的牛、绵羊和山羊3个物种在染色体水平上具有高度的相关性，因此，可用牛的卫星标记引物来构建绵羊或山羊的遗传基因图谱。

高度灵敏性和高度特异性

卫星DNAPCR扩增的高度灵敏性、高度特异性使得微卫星的检测十分方便而且准确。传统的方法是将PCR产物在非变性或变性聚丙烯酰胺凝胶中电泳进行基因分型。对于荧光素、同位素或生物标记的引物，可以采用其相应的显示方法，而对不带标记的引物可以银染后观察结果。荧光标记自动测序技术的发展使得微卫星DNA的基因分型变得快速、准确，从而大大地提高了微卫星标记分型效率和准确率，同时节约了实验成本和时间，使得应用微卫星进行了大规模基因组扫描成为可能。