合成肽疫苗的分子组成

合成肽疫苗分子是由多个B细胞抗原表位和T细胞抗原表位共同组成的，大多需与一个载体骨架分子相耦联。合成肽疫苗的研究最早始于口蹄疫病毒（FMDV）合成肽疫苗，主要集中在FMDV 的单独B细胞抗原表位（VPI 环）或与T 细胞抗原表位结合而制备的合成肽疫苗研究。虽然取得了一定的进展，但仍未获得一种具有理想保护作用的合成肽疫苗。

分析合成肽疫苗免疫效果不佳的原因主要有：疫苗缺乏足够的免疫原性，很难如蛋白质抗原那样诱导集体的多种免疫反应；B细胞和T 细胞抗原表位很难发挥协同作用:缺乏足够多的B细胞抗原表位的刺激。携带有单个抗原表位的合成肽疫苗对于不易变异的DNA病毒来说是可行的，如犬细小病毒合成肽疫苗，即含有一个相对保守的B细胞抗原表位的合成肽疫苗可完全保护动物。

但对许多其它病毒，特别是RNA病毒如FMDV，人工设计的合成肽疫苗的中和抗原位点A的作用仅占50%，而FMDV 存在诱导特异性中和抗体产生的多个不连续抗原位点;毒株间的VPI 环高度可变，变异毒株易于逃避机体正常免疫监视，从而导致易感动物的感染发病。如果这些免疫监视是建立在抗多个不连续抗原位点（多个B细胞表位）抗体上，那么这些变异株的逃逸现象就可能大大减少。这就可能解释为什么灭活病毒疫苗能够诱导完全保护，因为完整的病毒粒子可同时暴露两个或两个以上诱导中和抗体的抗原位点，一般说来，变异株的抗原位点全部发生变异的可能性较低，因此，病毒粒子不能逃逸免疫监视而使感染终止发生，关于这一点可以通过HIV-1 病毒观察到类似的抗不连续抗原位点的中和抗体反应现象。

为解决合成肽疫苗的免疫效果问题，对T 细胞组分进行了大量的研究，即应用两种表位的串联和组合的方式，如应用口蹄疫病毒VPI 上第140-160 位（B细胞表位）和第200-213 位氨基酸残基（T 细胞表位）串联，或再与第140-160 位氨基酸残基相串联，甚至在非结构蛋白（3ABC）上试图寻找一个或几个共同存在的Th 抗原表位与B细胞表位发生协同作用。