盘点 | 医学方向2020年度最佳项目文章TOP5，总影响因子：61.414

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盘点 | 医学方向2020年度最佳项目文章TOP5，总影响因子：61.414

鹿明生物

2021.1.08

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鹿明

生物

蛋白、代谢组学服务专家

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编者按：

上期小鹿为各位关注蛋白质组学、代谢组学研究的老师整理了欧易/鹿明生物植物方向2020年最佳项目文章TOP10，总影响因子：84.399；包含的物种有：水稻、拟南芥、紫薯幼苗、蚕豆、甘蓝型油菜、黄瓜、菠菜、大豆芽等，相继发表于Nature communication、Microbiome等高分期刊；

本期小鹿整理了欧易/鹿明生物医学方向2020年最佳项目文章TOP5，包含：研究对象、发表期刊、运用生物技术及研究方法流程，总影响因子：61.414；希望2021年鹿明生物再接再厉能更好的助力各位老师登上高分期刊

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TOP1

移植喂食了褐藻寡糖的小鼠的粪便菌可改善精子质量和精子形成

英文标题：Improvement in sperm quality and spermatogenesis following faecal microbiota transplantation from alginate oligosaccharide dosed mice

研究对象：小鼠粪便

发表期刊：Gut

影响因子：19.819

发表时间：2020年4月

合作发表单位：中国农业科学院与青岛农业大学

主要运用欧易/鹿明生物技术：LC-MS非靶向代谢组（由鹿明生物提供技术支持）、16s微生物多样性、转录组

最近在《Gut》和其它杂志上发表的12篇文章表明，肠道微生物群影响生育能力。应用粪便微生物群移植（FMT）手段改善生育能力是一个新兴的研究领域。文章运用LC-MS非靶向代谢组、16s微生物多样性、转录组学等多种检测手段发现了肠道微生物群与挽救精子形成和精子质量联系起来的机制。首次说明，肠道微生物群可以通过改善精子形成来治疗男性不育。

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TOP2

藻酸盐寡糖化小鼠的微生物群成功减轻了小肠粘膜炎

英文标题：Microbiota from alginate oligosaccharidedosed mice successfully mitigated small intestinal mucositis

研究物种：小鼠

发表期刊：Microbiome

影响因子：11.607

发表时间：2020年8月

合作发表单位：中国农业科学院与青岛农业大学

主要运用欧易/鹿明生物技术：LC-MS非靶向代谢组学（由鹿明生物提供技术支持）、转录组、16S微生物多样性检测等；

本文通过LC-MS非靶向代谢组、16s微生物多样性、转录组学等多种检测手段发现了海藻酸钠寡糖（AOS）通过增强细胞连接、恢复小肠功能以及改善可能有助于基因表达的转录因子来改善busulfan干扰的肠细胞膜；AOS改善血液代谢，以支持小肠功能的恢复。

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TOP3

EphB6基因缺陷小鼠的肠道菌群通过介导维生素B6动态平衡调节自闭症样行为

英文标题：The gut microbiota regulates autism-like behavior by mediating vitamin B6 homeostasis in EphB6-deficient mice

研究对象：小鼠粪便、脑组织

发表期刊：Microbiome

影响因子：11.607

发表时间：2020年8月

合作单位：孙逸仙纪念医院

主要运用欧易/鹿明生物技术：16S rRNA基因测序（欧易生物提供技术服务），LC-MS非靶标代谢组（鹿明生物提供技术服务）

文章研究的核心问题——肠道菌群与自闭症行为的关系，需要通过多项实验方案，将小鼠的行为学、组织电生理学、肠透性等表型结果，与蛋白质\\转录组等检测结果相互印证，更加入了16S rRNA基因测序和非靶向/靶向代谢组学这两项研究肠道微生物与宿主关系必不可少的分析手段，最终提出了肠道菌群影响小鼠脑功能缺陷的新机制，揭示了肠脑微生物群轴对ASD的发展有重大影响的巨大潜力。

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TOP4

LncRNA SNHG10通过正反馈环调节其同源基因SCARNA13促进肝癌的发生和转移

英文标题：LncRNA SNHG10 Facilitates Hepatocarcinogenesis and Metastasis by Modulating Its Homolog SCARNA13 via a Positive Feedback Loop

研究对象：肝癌肿瘤及配对癌旁组织、细胞系、BALB/c裸鼠

发表期刊：Cancer Research

影响因子：9.727

合作单位：四川大学华西医院

主要运用欧易/鹿明生物技术：RNA-seq测序分析、TMT定量蛋白质组学（由鹿明生物提供技术支持）

该研究运用RNA-seq测序分析、TMT定量蛋白质组学的多层组学方法报道了SNHG10通过miR-150-5p / RPL4-c-Myb阳性反馈环调节SCARNA13的表达，而SCARNA13通过调节HCC中的SOX9促进肝癌细胞的增殖、侵袭和迁移。揭示了非编码RNA在肝癌发生和转移中的作用，为肝癌确定诊断和治疗靶点提供新的途径。

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TOP5

肠系膜脂肪细胞中由脂肪去饱和酶（FADS2）介导的脂肪去饱和紊乱导致克罗恩病慢性炎症

英文标题：Disturbance of Fatty Acid Desaturation Mediated by FADS2 in Mesenteric Adipocytes Contributes to Chronic Inflammation of Crohn''s Disease

研究对象：人的脂肪组织

发表期刊：Journal of Crohn''s and Colitis

影响因子：8.658

发表时间：2020年5月

合作发表单位：南京大学医学院附属金陵医院、青岛大学附属医院、南京大学医学院附属鼓楼医院、北京大学人民医院、中科院遗传与发育生物学研究所

主要运用欧易/鹿明生物技术：LC-MS非靶代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)

本文通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法，发现了炎症肠系膜脂肪细胞和巨噬细胞表型转化中有效调的节的细胞因子：FADS2，探究了肠系膜脂肪细胞的代谢谱以及在CD背景下关键代谢变化与局部炎症之间的相关性，描绘了肠系膜脂肪细胞的代谢谱，为治疗慢性炎症性的克罗恩病提供了理论依据。

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鹿明生物

上海鹿明生物科技有限公司，一直专注于生命科学和生命技术领域，是国内早期开展以蛋白组和代谢组为基础的多层组学整合实验与分析的团队。经过近数年的发展沉淀，公司建立起了iTRAQ/TMT、DIA、PRM、修饰蛋白组等蛋白组学技术平台和全谱代谢组、靶向代谢组、拟靶向代谢组、脂质组等代谢组学技术平台以及相应的数据整合分析平台，并建立了科学完整的服务流程和精细规范的操作标准。