4D技术新应用-FFPE蛋白质组学&修饰组学

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4D技术新应用-FFPE蛋白质组学&修饰组学

精准医学与蛋白组学

2021.9.03

景杰学术 | 报道

随着以4D技术为代表的质谱方法的不断进步，蛋白质组学也逐渐从基础研究进入到了临床分析的领域。由于蛋白质是功能的执行者和药物的直接靶点，因此蛋白质组学在临床方面的应用进展一直备受瞩目。

然后目前的临床蛋白质组学研究，多数仍然是以新鲜或冰冻组织为样本进行的。这些样品往往缺乏足够长的随访信息，导致了其实际的研究意义受限。另一方面，FFPE是临床一直以来最常用的样品保存方法，这类样品不但数量多、而且时间长、随访信息完整，如果能够将这些样品应用于蛋白质组学分析，无疑会具有更好的临床价值 [ 1-4 ]。

景杰生物已于近期隆重推出4D技术新应用-福尔马林固定石蜡包埋组织（FFPE）样本定量蛋白质组学，助力各位老师的研究。

图1. 基于石蜡包埋样本的蛋白质组学流程

相较于传统3D技术方法，基于4D平台的蛋白质组学无论是在鉴定深度还是准确性上都能带来全面的提升。我们最新的测试结果显示，不同类型 FFPE 肿瘤组织样本的4D蛋白质组学可鉴定约4000个蛋白，其中骨肉瘤（Osteo sarcoma）能鉴定超过4500个蛋白，前列腺癌（Prostate cancer）能鉴定约4000个蛋白，肾母细胞瘤（nephroblastoma）能鉴定超过5000个蛋白，部分结果如图2所示。

图2. 基于4D平台的FFPE蛋白质组学测试结果

产品类型：基于4D平台的Label-free蛋白质组学

送样标准：3-5片，4cm²组织*10µm厚的石蜡切片样本

鉴定深度：≥4000个蛋白

我们的优势：

1. 更少送样量；

2. 更高蛋白鉴定深度；

3. 重复性好，定量更加准确。

更多相关技术信息，请拨科服热线（400-100-1145）或咨询当地景杰生物销售工程师。

参考文献

1. Fabian Coscia, et al. (2019) A streamlined mass spectrometry-based proteomics workflow for large scale FFPE tissue analysis. bioRxiv.

2. Yi Zhu, et al. (2019) High-throughput proteomic analysis of FFPE tissue samples facilitates tumor stratification. Molecular Oncology.

3. Mark A. Eckert, et al. (2019) Proteomics reveals NNMT as a master metabolic regulator of cancer-associated fibroblasts. Nature.

4. Carolina Moretto Carnielli, et al. (2018) Combining discovery and targeted proteomics reveals a prognostic signature in oral cancer. Nature Communications.

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