NMR FAQ
在进行化合物的结构归属时,化合物结构中含有对称片段,可否自定义原子编号为一致?即如何按照科学家自己的意愿对化合物结构编号?
A: 可以在结构上进行手动编号,对称的结构可以编号一致。在ACD 画图软件Chemsketch左下边条中有手动编号工具按钮。
点击此按钮可以在机构原子上点击左键进行手动编号。编号时可以自定义起始编号,可以自定义前缀,后缀。
在进行化合物的结构归属时,结构中存在磁不等价的CH2上两个H,软件自动编号时是否能加以区分?例如区分为H1a,H1b?
A: 软件自动编号时不能自动区分,如需将两个H分别编号为H1a,H1b,需将两个H在结构上画出来,再使用手动功能,设定编号的前后缀然后编号。
需要调取布局时,可以点击右上角布局管理调取相应的布局。
在进行谱图处理里,软件有一个局部放大Zoom窗口,如何关闭它?
A: 软件在打开谱图后,用户在放大谱图时,软件界面下半部分会显示Zoom窗口,通常用户需要关闭此窗口。可以点击Zoom窗口边栏关闭此窗口,在关闭时可以选择“Don’t ask me again”来永久关闭此窗口,软件下次就不会再显示此Zoom窗口,如需再此显示可以在软件菜单栏view菜单下选择“Zoom Area”。
如何快速知道氢谱的氢的个数是否与结构上氢的个数一致?
A: 可以在head information中设定将此信息,此信息为软件的default设定。
如果此信息不显示,可以在软件菜单栏Option/Head information中进行设定。设定时选择User Data Number of Nuclei。
在同一窗口下打开两张谱图进行比较时,调整纵坐标会同时调整两张谱图的纵坐标,如何只调整其中一张谱图的纵坐标?
A: 可以在菜单栏 series/manual offset/edit offsets调整单张谱图的纵坐标高度
调整时调整 Individual Scaling/Vertical Scale数值。注意调整的为当前红色谱图的纵坐标。
如何只对谱图的部分区域进行自动积分?
A: 在自动积分功能图标右侧黑色三角可以设定自动积分参数,勾选 In Zoomed Area Only,再将希望自动积分的区域放大,完成自动积分。
如何只对谱图的部分区域进行自动积分?
A: 在自动积分功能图标右侧黑色三角可以设定自动积分参数,勾选 In Zoomed Area Only,再将希望自动积分的区域放大,完成自动积分。
DMSO溶剂峰不明显,手动定义溶剂峰校正化学位移后再使用 Peak Analysis by Peak Level时软件自动将2.5ppm附件的峰定义为溶剂峰,如何避免此状况?
A: 在使用Peak Analysis by Peak Level功能时,调整其选项将Detect Solvent or Water Signal功能去除。
如何积分含F,P化合物的C谱?
A: 通常F,P对相邻的C具有耦合作用使C谱裂峰,在积分时可以将结构导入软件中,再使用自动积分功能,软件一般能识别F,P对C谱的裂峰,正确进行积分。在一些情况下如需手动积分处理,可以先将所有峰进行积分处理后合并那些F,P的耦合峰。
点击谱图处理工具栏按钮开启谱峰合并功能,按住键盘Shift依次选择需要合并的峰,再松开shift键完成谱峰合并。
结构与谱图信号归属完全后,能否直接添加另外一个结构,不影响当前结构的信号归属?
A: 可以添加另外一个结构,但是需要注意添加方式。点击结构窗口右下角添加新结构。添加完成后注意结构窗口的水印 Chemical Structures(2/2),当前显示的为新添加结构,如需切换结构请点击结构窗口
绿色箭头图标进行切换。
Spectrus Processor 内两张二维谱图如何叠加操作,如在HMBC谱图上叠加HSQC谱图?
A: 同时打开HMBC和HSQC谱图,全选两张谱图,在菜单栏 Series 下选择Collect Spectra,将两张谱图叠加显示。
在菜单栏option中选择2D NMR Preferences,此设定窗口可以设定叠加后谱图信号显示颜色,在No下拉菜单中选择相应图层后,在右侧Coloration Scheme中设定不同颜色。
Chemsketch报告中需要局部放大谱图,如何操作?
A: 当在Chemsketch界面生成报告后,可以使用Chemsketch左侧边栏的放大按钮进行谱图局部放大,具体操作为,点击放大按钮,按住鼠标左键拖动选择需要放大谱图区域,单击左键将需要放大的区域谱图放到合适的位置,拖动放大区域谱图边框,改变谱图区域大小,完成放大操作,二维谱图局部放大,请同样参照此操作。
ACD/Labs的核磁工具软件主要有三档。
第一档的工具是Spectrus Processor,这是一个通用性的谱图处理和报告工具,是合成研究员和分析研究员的日常工具,请点击此处查看Spectrus Processor的功能;
第二档的工具的代表者是NMR Workbook Suite(点击此处查看),这是定位在需要对目标物进行全面的基于核磁技术的研究和确证的工具,利用各种基于人工智能的预测以及高级的评判算法,对结构与谱图进行快速但又及其完备的结构确认;
第三档的工具则是大名鼎鼎的计算机辅助结构解析软件Structure Elucidator Suite(点击此处查看), 这是对全未知结构进行基于所有谱学知识的结构解析的工具,它具有超大规模的知识库以及目前可用性最高的结构列举和推演算法,不论用于杂质结构解析或者天然产物结构解析,都是最佳工具。
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