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如何消除组织中DSS对核酸质量的影响

海狸生物医学
2023.7.24

如何消除组织中

DSS对核酸质量的影响




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最近在研究DSS诱导小鼠急性肠炎模型实验,今天重新用Trizol法做了RNA提取,PCR又又又没有曲线出来,实验一直卡在核酸提取这一步,我快要emo了。。。

核酸提取效率受什么影响?提取方法、操作手法、还是烧香拜佛法?




大家是否也遇到过类似的问题?

不用担心,海狸已经准备了一份完美的提取方案,一定要看到最后哦。




海狸小课堂
为什么会选择DSS诱导小鼠急性肠炎模型?

葡聚糖硫酸钠盐(Dextran Sulfate Sodium Salt,DSS)结肠炎模型是肠炎动物模型应用最为广泛的一种,通过给予动物自由饮用不同浓度的DSS水溶液,根据用药时间及用药周期可制成急性和慢性两种结肠炎动物模型

DSS处理的样本对核酸提取有没有特殊要求?

现有的研究发现DSS处理并不会导致组织样本DNA和RNA的完整变性,但是DSS处理对PCR扩增会造成严重的抑制。在肠道微生态研究的研究中,DSS处理的样本对16srDNA的扩增也有很大的影响。因此DSS处理的样本对核酸提取的方法有更高的要求。

如何避免DSS对核酸提取及后续PCR检测的影响?

针对DSS对核酸提取及PCR扩增造成的抑制,海狸生物提供血液RNA提取试剂盒适用于从细胞、组织消化液、血液等样本中,快速、高效地提取高质量RNA。


NO.1


应用案例

实验样本:DSS诱导小鼠急性肠炎模型结直肠组织


实验方法与材料:分别利用Trizol法和BeaverBeads血液RNA提取试剂盒抽提RNA,逆转录成cDNA后用SYBR Green Mix进行qRT-PCR检测靶基因的表达。


1. Trizol法和磁珠法试剂盒提取的RNA样本QPCR检测结果图

实验结果:qRT-PCR结果显示Trizol法抽提的RNA并不能测出靶基因的表达,而使用BEAVER试剂盒抽提的RNA样本,检测结果良好,Ct值正常。

NO.2


应用案例

实验样本:血液样本


实验方法:使用BeaverBeads血液RNA提取试剂盒,分别用自动化和手动操作两种方法抽提RNA,使用安捷伦4150验证RNA完整性和纯度。


2. 安捷伦4150检测效果

实验结果:结果显示提取的RNA浓度基本保持一致,所有样本RNA的完整性和纯度较为理想,RIN值基本保持7.5以上。




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关于海狸



























海狸创立于2011年,位于苏州工业园区。企业专注于纳米磁珠技术的研发和产业化,服务于体外诊断、生物制药、动物疫病检测、环境检测、食品药品安全检测、生物科研等领域;提供纳米磁珠原料、蛋白偶联中间体、免疫标记与捕获磁珠、核酸提取磁珠及试剂盒、真菌毒素净化试剂盒等产品、并辅助自动化设备及配套的生物耗材;拥有ISO9001和ISO13485国际质量管理体系认证,部分产品取得国内一类医疗器械产品备案及生产备案。




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