DW行业解决方案|肠道菌群研究中的微生物仪器
肠道菌群与人类健康密切相关,目前肠道菌群的研究,大多采用基于高通量测序的方法如宏基因组学(Metagenomic)。
其优势在于无需菌种培养,局限性主要表现在,采用不同的提取扩增方法或生物信息学分析方法往往会导致不同的分析结果,不能区分细菌的死活和排除干扰DNA,不能准确鉴定含量较低的菌(如粪便中低于105cfu/g的细菌)或稀有菌种。
针对这些局限性,相关研究人员提出了培养组学的方法。杭州大微针对肠道微生物研究热点,推出肠道菌群研究解决方案。
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DW-100A-K 智能厌氧微生物培养系统
用于肠道微生物分离培养研究
许多研究表明,肠道菌群中约99%以上的微生物为厌氧微生物。如果想得到肠道中的微生物,拿到具体的菌株,需进行厌氧培养。
DW-100A-K智能厌氧微生物培养系统可用于肠道来源的各种厌氧菌及微需氧菌的培养,同时还可根据实验需要选择特定氧气浓度(1%-15%可选),满足特定氧浓度菌的培养需求。肠道厌氧微生物的培养研究在很大程度上可以扩展肠道微生物菌库,让人体肠道菌群种类增加,在未来可通过培养条件的优化持续增长。
2
DW-M80 自动微生物生化鉴定系统
用于肠道分离菌研究
3
MALDI-TOF 质谱
用于肠道分离菌的鉴定
首先将样本分别置于不同培养条件下培养,其培养条件针对不同类型菌种,然后使用生化鉴定或MALDI-TOF MS快速鉴定培养所得的微生物。
若质谱鉴定无结果,再使用16s rRNA测序法鉴定。若测序结果与已知菌种相似性<98.65%,则认为是新种,新菌种进一步进行全基因组测序并将新信息放入参考基因组数据库。
MALDI-TOF MS凭借其准确、快速、低成本、高通量的鉴定特点,使得MALDI-TOF MS能够成为培养组学的重要支撑,助力传统微生物纯培养技术重生并巩固其在菌群研究中的重要地位。
多组学研究互补,才能够更好的对人类菌群进行探索和解答。我们相信微生物质谱技术必将在肠道菌群研究中发挥更大的作用。
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