Ion Torrent及3730XL测序服务

       Ion Torrent 由于硬件设备无需光学检测和扫描系统,并且使用天然核苷酸和聚合酶、无需焦***酸酶化学级联, 无需标记荧光染料和化学发光的配套试剂,因此测序成本低,其应用范围涵盖 Sanger 方法和已有高通量测序技 术的应用,如基因组 DNA 序列测定(微生物基因组测序、线粒体测序、靶向测序)、 DNA 扩增子测序等。 
 

Ion Torrent 测序原理 

      Ion Torrent 是最新一代的测序技术,它的问世给测 序技术的应用带来了激动人心的进展。它的核心技术是 使用半导体技术在化学和数字信息之间建立直接的联系。 在半导体芯片的微孔中的微球上固定 DNA 链,随后依次 掺入 ACGT。随着每个碱基的掺入,释放出氢离子,在 它们穿过每个孔底部时能被检测到,通过对 H+ 的检测, 实时判读碱基。与其他测序技术相比,使用该项技术的 测序系统更简单、更快速、及更灵活。  

快捷的实验流程 

主要应用 

数据分析流程

       Torrent Suite 软件可对 Ion Torrent PGMTM 产生的数据进行初步分析,实现捕获电信号值,并经计算转换 为碱基序列。进一步可通过 Torrent Browser 软件得到质量控制指标及碱基序列,从而确定测序实验的质量,参 照指控信息筛选出的高质量的序列进入下一步分析。 

芯片选择方案

     1、线粒体:差异大,哺乳动物约 16Kb,而最小的植物线粒体约 100 Kb
     2、叶绿体:差异大,120~180Kb
     3、肺炎支原体:M.pneumoniae ~800Kb

     4、肺炎链球菌:S.pneumoniae ~2 Mb

     5、结核分枝杆菌:M.tuberculosis ~4Mb

     6、大肠杆菌:E.coli O157:H7~5Mb

     7、酿酒酵母:S.cerevisiae ~12Mb

     8、纤维堆囊菌:S.cellulosum ~13Mb(已知最大的原核基因组)  

3730XL测序服务 

服务优势

      1、 高精度:适应不同客户需求,可检测多种疾病 / 性状相关基因以及进行低、中、高分辨分型
      2、 高通量:适应不同客户需求,每次可检测 10~5,000 份样品
      3、 高质量:建立完善的质量管理制度,采用严格的全程质控体系,确保高通量分型中样品不会混淆以及分型结果准确性
      4、 专业化:拥有高素质的研发和服务团队,可帮助客户发现新基因和开展其他科研工作,例如针对特定基因的检测

测序原理及实验流程

      博奥晶典疾病 / 性状相关基因测序分型系统基于 Sanger 双脱氧链末端终止法原理,即测序体系内含四种 dNTP 以及一定比例的双脱氧核苷酸 ( 称为 ddATP, ddCTP, ddGTP, ddTTP), 然后进行疾病相关基因的 DNA 链的末端碱基延伸反应。延伸反应时双脱氧核苷酸会随机掺入 DNA 链,使延伸反应终止,产生一系列长短不一 的 DNA 链。通过识别这些 DNA 链可得到相应基因的 DNA 碱基序列,再通过博奥基因检测软件对碱基序列分析 就可判断样品的基因变异情况。 
 

Ion Torrent及3730XL测序服务信息由北京博奥晶典生物技术有限公司为您提供，如您想了解更多关于Ion Torrent及3730XL测序服务报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。

注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途