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iTRAQ定量蛋白质组学

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参考报价: 面议 型号: iTRAQ定量蛋白质组学
品牌: 基尔顿 产地: 上海
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iTRAQ

背景简介:

iTRAQ和TMT的技术原理一样,所不同的是二者的分子结构有差异。与SILAC相比(标记蛋白质),iTRAQ和TMT是对肽段进行标记的。依据iTRAQ/TMT标签的质量数差异,通过MS实现对多组样品中的蛋白质进行相对定量:

SILAC是通过MS( MSl)对蛋白质进行定量,而iTRAQ/TMT是通过二级MS( MS/MS.MS2)进行定量的;

iTRAQ/TMT兼容性好,并且能同时分析多达8-10组的样品,分析通量高。


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试验流程

1、分别提取蛋白质并定量;

2、Trypsin分别对蛋白进行酶解,提取肽段;

3、用不同质量数的iTRAQ/TMT标签分别对肽段样品进行标记:

4、标记完成后,混合样品,用SCX进行组分分离(15-20组分);

5、对每个组分进行LC-MS分析:

6、蛋白质鉴定与定量分析,筛选差异表达的蛋白;

7、生物学实验验证(Western blot,EUSA等):


蛋白质组学

蛋白质组分析(proteomics) 是对生物蛋白组(proteome) 的分析与检测,蛋白组分析首先要将混合蛋白质分离, 分离的主要方法是蛋白双向电泳。已被分离的蛋白质由质谱分析对其进行鉴定。

iTRAQ的4种同位素标记试剂由4种相对分子质量分别为114、115、116和117的报告基团(reporter group),相对分子质量分别为31、30、29 和28 的质量平衡基团(balance group)以及一个相同的肽反应标记试剂基团(peptide reactive group)组成。不同的报告基团分别与相应的平衡基团相配后,相对分子质量均为145,即等量异位标签(isobaric tag)。

    将蛋白质裂解为肽段,然后用iTRAQ试剂进行差异标记。由于iTRAQ试剂是等量的,即不同同位素在标记同一多肽后在第一级质谱检测,分子量完全相同,用串联质谱方法对在第一级质谱检测到前体离子(precursor ion)进行碰撞诱导解离,产物离子通过第二级质谱进行分析。在二级质谱分析过程中,报告基团、质量平衡基团和多肽反应基团之间的键断裂,质量平衡基团丢失,产生低质荷比(m/z)的报告离子。由于二级质谱可分析相对分子质量相差1的报告基团,不同报告基团离子强度的差异就代表了它所标记的多肽的相对丰度。同时,多肽内的酰胺键断裂,形成一系列b 离子和y 离子,得到离子片段的质量数,通过数据库查询和比较,可以鉴定出相应的蛋白质前体.
 
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