PacBio RSII测序系统，是基于单分子实时（Single Molecule Real Time, SMRT）DNA测序技术和纳米微孔应用的革命性第三代测序平台，可以在一天内完成从样品制备到测序和读取序列的全过程。

毅新兴业采用第三代测序平台PacBio RS II，平均读长达到8.5Kb，可以跨越动植物基因组组装过程的的中、高度重复序列，识别杂合基因组区域，更全面的覆盖整个基因组，结合全长转录组数据时代对基因组进行注释，得到前所未有的超高精度动植物基因组图谱，从而引领基因组测序大步进入3.0时代！

【小基因组完成图】

第三代测序技术全面解决了二代测序海量数据拼接难、变异检测假阳性高、稀有突变被淹没、高GC含量区域无法跨越、高度片段无法准确测定等困扰，可以准确的实现细菌基因组完成图的组装，更加准确的检测结构变异，同时还能检测出全基因组、单碱基水平的表观修饰信息。与一代测序、二代测序相比，三代测序技术具备明显的优势，已经成为小基因组领域行业“金标准”。

Ø  小基因组de novo组装方法

参考文献:

[1] Tisserant, Emilie, et al. Genome of an arbuscular mycorrhizal fungus provides insight into the oldest plant symbiosis.Proceedings of the National Academy of Sciences 110.50 (2013): 20117-20122.

【表观基因组学】

与表观遗传学调控和DNA损伤相关的DNA碱基修饰（如甲基化）在多个生物过程中扮演了重要角色，包括生长和衰老、免疫、细菌致病性及疾病发展等。

毅新兴业利用Pac Bio测序平台，不需要额外实验步骤，在测序同时能通过聚合酶动力学分析直接检测多种碱基修饰，包括A的甲基化、C的甲基化、C的羟甲基化等。

l  Pac Bio检测碱基修饰原理：

l  应用实例：

参考文献:

 [1] Murray, Iain A., et al. The methylomes of six bacteria. Nucleic acids research 40.22 (2012): 11450-11462.

【全长转录组】

目前常规的第二代测序技术普遍存在诸多局限性，毅新兴业利用第三代测序平台PacBio RS II，可以直接得到从5’端到3’端的高质量全长转录本信息，转录组不再需要组装，所测即所得，从而高性价比地得到基因的全长isoforms序列，同时使得isoforms定量更加可信，大大缩短后续的应用分析时间。

Ø  文库构建

Ø  分析内容

参考文献:

 [1] Shin SC,et al.Advantages of Single-Molecule Real-Time Sequencing in High-GC Content Genomes. PLoS One. 2013 Jul 23;8(7):e68824.

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