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DNA甲基化是重要的表观遗传学标记信息,获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据,对于表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。我们以新一代高通量测序平台为基础,结合全基因组Bisulfite处理和生物信息数据分析技术,进行低成本、高效率、高准确度的全基因组DNA甲基化水平图谱绘制。特定物种的高精确度甲基化修饰模式的分析,必将在表观基因组学研究中具有里程碑式的意义,并为细胞分化、组织发育等基础机制研究,以及动植物育种、人类健康与疾病研究奠定基础。
一、标准信息分析
1. Bisulfite测序序列与参考基因组比对;
2. 测序深度和覆盖度分析:C碱基有效测序深度的累计分布统计和不同reads测序深度下的基因组覆盖度;
3. C碱基甲基化水平评估:C、CG、CHG和CHH平均甲基化水平;
4. 全基因组甲基化水平分布趋势:
1) 甲基化C碱基中CG、CHG和CHH的分布比例;
2) CG、CHG和CHH中的所有C的甲基化水平;
3) 各条染色体、不同基因区域和不同基因元件区域中CG、CHG和CHH中C的甲基化水平;
4) CHG和CHH中甲基化C附近9 bp的序列特征分析;
5) 全基因组甲基化图谱:染色体水平的甲基化C碱基密度分布,不同基因组区域和转录元件中的DNA甲基化水平;
6) 差异性甲基化区域分析(DMR)。
二、定制化信息分析
可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容。
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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途