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宏基因组测序对特定生境样品中微生物群体基因组进行序列测定,进而分析微生物群体基因组成及功能,解读微生物群体多样性与丰度,探求微生物与环境,微生物与宿主之间的关系,发掘和研究新的、具有特定功能的基因。
实验流程:
生物信息分析:
1. 原始数据整理、过滤及质量评估
2. 基因集分析
基因功能注释
基因功能丰度差异分析
丰度差异的基因 GO 富集分析
丰度差异的基因 KEGG 富集分析
聚类分析(热图)
多元统计分析(根据实验设计)
3. 基于物种丰度分析:
稀释曲线
Alpha多样性分析
物种丰度差异分析
聚类分析(热图)
4. 基于群落结构分析:
单样品物种分布
多样品物种分布
5. 微生物基因组序列组装和拼接
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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途