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参考报价: | 面议 | 型号: | 生存分析 |
品牌: | 欧易生物 | 产地: | 上海 |
关注度: | 9 | 信息完整度: | |
样本: | 暂无样本 | 典型用户: | 暂无 |
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生存分析
生存分析是对生存现象和响应时间数据及其统计规律进行研究,将事件的结果(终点事件)和出现这一结果所经历的时间结合起来分析的一种统计分析方法,生存分析与其他多因素分析的主要区别,就是生存分析考虑了观测结果出现的时间长短。
利用TCGA数据库,结合客户芯片筛选获得的mRNA/lncRNA/miRNA,分析mRNA/lncRNA/miRNA在TCGA对应癌症数据库中的表达量的高低与病人存活时间的关系,绘制K-M图。
前置分析条件
客户关注的癌症类型在需要在TCGA中存在
客户指定的分子需要包含对应的染色体位置
限定物种:人
分析结果
· TCGA对应癌症病人的临床信息;
· 每一个分子对应的表达数据;
· 每一个分子对应的K-M生存曲线图
Demo示例
Demo结果解读
K-M分析结果显示,该分子的高表达、低表达与病人的总存活时间存在显著的相关关系,
其中图上Y轴表示累计生存率,X轴对应时间,共计样本数量406份,所用的统计方法为Logrank
案例展示
案例一 肝癌中PFKFB3主要定位于细胞核且在细胞增殖周期中起重要调节作用
研究背景
肝癌是仅次于肺癌的第二大癌症,目前仍缺乏治疗肝癌的有效手段。PFKFB3在多种癌症中高表达且可以显著加快糖酵解的速度。有研究报道除糖酵解外,PFKFB3也定位于细胞核发挥调控功能(糖酵解主要定位于细胞质)。然而,PFKFB3在肝细胞癌中的调控作用尚不明确。
研究内容与结果
欧易生物携手复旦大学中山医院,通过表达谱芯片探索肝细胞癌中PFKFB3的作用机制。作者发现PFKFB3主要定位于癌细胞的细胞核中,可以调控癌细胞的生长。过表达PFKFB3显示PFKFB3的表达量与肿瘤大小、生存率等密切相关;敲除PFKFB3可以抑制癌细胞的生长,导致细胞周期停滞和细胞凋亡。表达谱芯片分析发现沉默PFKFB3可以通过AKT/ERCC1通路抑制DNA的修复。此外,PFK15(PFKFB3的抑制剂)显著抑制了肿瘤的生长。加入PFKFB3的抑制剂PFK15发现PFK15可以抑制肝癌细胞的生长,表明PFKFB3可以成为肝癌的一个潜在治疗靶点。
技术路线
a)基于TCGA数据库进行K-M生存分析的结果;b,c)WB结果;d)定量验证结果;
e)癌和癌旁组织免疫组化实验结果;f,g)基于作者实验中心的OS和DFS的数据进行K-M生存分析的结果
参考文献
Shi W K, Zhu X D, Wang C H, et al. PFKFB3 blockade inhibits hepatocellular carcinoma growth by impairing DNA repair through AKT. Cell Death Dis. 2018, 9(4): 428. (IF: 5.965)
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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途