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参考报价: | 面议 | 型号: | 微生物基因组测序 |
品牌: | 欧易生物 | 产地: | 上海 |
关注度: | 7 | 信息完整度: | |
样本: | 暂无样本 | 典型用户: | 暂无 |
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微生物基因组测序
利用PacBio读长长、Illumina测序准确率高的特点,采用PacBio三代测序数据结合Illumina二代测序数据,可以高 效进行微生物基因组的de novo组装。
技术优势
读长超长
平均3-10Kb,至高可达30Kb以上
直接对单个分子进行测序
有效避免PCR扩增偏好性、GC偏好性,保证序列的均匀覆盖
同步测定碱基修饰
无需处理,直接实现各种碱基修饰的读取,包括4-mC、6-mA、5-mC、5-hmC
微生物基因组测序流程
案例展示
案例一 大肠杆菌基因组de novo测序
本研究对大肠杆菌E.coli三个菌株( BL21、Bal225、DH5α)分别进行了基因组测序和de novo组装。对三个菌株分别利用PacBio、Miseq、IonTorrent进行测序和de novo组装,结果表明,PacBio单独组装所获得基因组contig数目较少、N50长度较大;而利用二代和三代测序数据的混合拼接,可以对基因组上的SNP实现有效鉴别。并且PacBio RS同步实现了三个菌株基因组5-mC碱基修饰的识别。
参考文献
Powers J, Weiqman V, Shu J,et al. Efficient and accurate whole genome assembly and methylome profiling ofE. coli.BMC Genomics, 2013;14:675.
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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途