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WGS全基因组脱靶检测

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参考报价: 面议 型号: WGS全基因组脱靶检测
品牌: 诺禾致源 产地: 北京
关注度: 12 信息完整度:
样本: 暂无样本 典型用户: 暂无
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全基因组范围内进行广泛扫描,精确检测编辑信息。
WGS全基因组脱靶检测:对具有参考序列(Reference Sequence)的不同个体,采用WGS方法进行全基因组测序,经生物信息分析,在全基因组范围内发生的SNPs和InDels进行精确分析。

1.检测全面

2.精准分析

3.专业背景强

基于成熟的生物信息分析人才,专业的项目分析,可以根据客户不同要求分析个性化内容,在全集因组范围内对编辑位点和脱靶位点,进行精确的定位分析,并且针对于感兴趣片段进行准确定位。

科学的研究方案

从建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

1、客户需要提供给我们参考基因组序列信息;
2、编辑物种,编辑类型;
3、sgRNA序列信息;
4、编辑基因序列信息或插入片段序列。

信息分析

脱靶检测分析内容
基因敲除基本信息分析部分
1.原始序列信息
2.测序数据质量评估
3.将原始序列与参考基因组进行比对分析,统计覆盖度,检测SNP/InDel
4.sg RNA 同源的序列区域进行筛选
筛选全部基因组区域内所有 sgRNA 同源区域,并根据同源分数进行排序

高级信息分析
5.sgRNA 同源区域脱靶检测
编辑前后样本序列信息比较,SNP、InDel进行分析,并且对 sgRNA 上下游100bp序列,做进一步分析,避免错失突变位点序列
6.PAM区扫描潜在脱靶位点
在 sgRNA 同源区域中,筛选 PAM区 NGG结构,例如 AGG,TGG,CGG,GGG,对 PAM区发生的SNP,InDel 情况进行统计
基因插入基本分析
1. 数 据质控:去除含接头和低质量的数据
2. 与 参考基因组进行比对
3.统计测序深度及覆盖度
4. SNP/InDel 变异结果检测

高级分析
5.将插入序列mapping 到参考基因组中,确定插入具体位置
6.对插入位置或上下游基因进行功能注释
7.分析插入类型,杂合插入,纯合插入或者脱靶
8.分析同源序列插入情况


WGS全基因组脱靶检测信息由北京诺禾致源科技股份有限公司为您提供,如您想了解更多关于WGS全基因组脱靶检测报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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