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真菌属于较低等的真核生物,种类繁多,在自然界中存在着大量能引发动植物病害的致病菌,也包含许多具有重要的药用价值和食用价值的有益真菌。因此,合理利用有益真菌,控制和预防有害真菌对人类的生产和生活具有重要的意义。基因组学是对真菌生长的遗传机制的全面理解,根据不同真菌物种特点,通过结合第二、三代对真菌进行基因组测序,可以快速而低成本的达到接近完成图和完成图的标准。
技术路线:
技术方案:
结果案例:
真菌基因组完成图
COG功能分类图
技术指标:
参考文献:
1、Jane Yeadon1, et al.Integrative Biology of a Fungus: Using PacBio® SMRT® Sequencing to Interrogate the Genome, Epigenome, and Transcriptome of Neurospora crassa.2014
2、Zheng A, et al. The evolution and pathogenic mechanisms of the rice sheath blight pathogen. Nat Commun. 2013;4:1424
3、Chin CS, et al., Nonhybrid finished microbial genome assemblies from long-read SMRT sequencing data. Nat Methods, 2013;10(6):563-9
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