AQUA绝对定量分析是一种靶向定量蛋白质组学技术，在各类定量蛋白质组学研究中应用广泛。绝对定量策略可用于蛋白质及其修饰状态的绝对定量。将稳定同位素标记的合成肽作为内标，可以模拟蛋白水解形成的天然肽，也可以利用共价修饰（如，磷酸化，甲基化，乙酰化等）来制备。通过在串联质谱中使用选择反应监测分析（selected reaction monitoring, SRM），将AQUA内标肽用于蛋白水解后精确定量地测定蛋白质和翻译后修饰蛋白质的绝对水平。

生物质谱技术的进步促进了大规模量化细胞内蛋白质表达水平分析方法的进步。

绝对定量分析（AQUA）

蛋白质绝对定量策略是蛋白质定量和翻译后修饰的有效检测手段。通过使用含有稳定同位素标签的合成多肽实现绝对定量：通过发现质谱信号与蛋白质浓度之间的关系为基础，每摩尔蛋白质中三个最强的胰蛋白酶肽的平均质谱信号响应是恒定的，变异系数小于10%。只要给定一个内标（含有问答同位素标签的合成多肽），通过质谱信号与蛋白质浓度之间的关系可用于测定通用信号响应因子（counts/mol）。所有测定的蛋白质的通用信号响应因子都是相同的。

绝对定量方法依赖于使用合成内标肽，该肽在消化过程中以已知浓度引入到细胞裂解液中。在串联质谱仪检测过程中，通过SRM法对水解的蛋白样品进行分析，可以直接检测和定量天然肽和同位素标记的AQUA内标肽。该方法的简便、灵敏，加上串联质谱仪的广泛应用，使AQUA绝对定量分析策略成为一种直接从细胞裂解物中测定蛋白质水平和翻译后修饰的有效的方法。

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