• • 服务名称：

    数据分析服务

  • 提供商：

    cnkingbio

  构建基因的ceRNA调控网络——CeRNA Network

  
  
        分别对miRNA与mRNA、miRNA与lncRNA进行靶向预测，并根据表达趋势取负相关。根据结果找出具有mRNA-miRNA-lncRNA关系的mRNA/lncRNA对。计算差异基因和差异lncRNA间的共表达关系，挑选出互为正相关的基因与lncRNA。根据上述分析结果，选出存在于mRNA-miRNA-lncRNA关系中，并互为正相关的mRNA/lncRNA对。这对mRNA/lncRNA即可能互为ceRNA，再通过MREs的数量和结合分值评估ceRNA的竞争能力。结果样式如下：

  
   

  文章案例：为了研究晚期喉癌组织中lncRNA和mRNA的异常表达，我们利用lncRNA和mRNA整合芯片筛选了9对原发性IVA期喉癌组织和癌旁组织的lncRNA和mRNA表达谱，发现1459个差异表达的lncRNAs和2381个差异表达的mRNA，其中包括846个上调的lncRNAs和613个下调的lncRNAs，1542个上调的mRNAs和839个下调的mRNAs。对差异lncRNA和mRNA进行共表达分析，加上生信预测miRNA-mRNA及lncRNA-miRNA关系，最后构建出ceRNA网络，筛选核心lncRNA-miRNA-mRNA。后期采用qRT-PCR方法进一步验证。这项工作证实了lncRNAs和mRNAs是晚期喉癌的潜在生物标志物，可用于未来的进一步研究。（芯片检测+数据分析由中康博提供）
   

  

   
  参考文献： Ling Feng et al. Integrated Analysis of Long Noncoding RNA and mRNA Expression Profile in Advanced Laryngeal Squamous Cell Carcinoma. Plos one. 2016. 

   

  
  

ceRNA Network信息由北京中康博生物科技有限公司为您提供，如您想了解更多关于ceRNA Network报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。

注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途