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信号通路网络Pathway Network

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参考报价: 面议 型号: 信号通路网络Pathway Network
品牌: 中康博生物科技 产地: 全国
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    • 服务名称:

      数据分析服务

    • 提供商:

      cnkingbio

    信号通路作用网络——Pathway Network


          根据KEGG数据库中的Pathway间的相互作用关系,构建差异基因参加的显著性Pathway之间的作用网络,确定显著性Pathway主要的分布(比如免疫、肿瘤等等)利用图论的方法分析确定网络中的核心Pathway群及其所属的靶基因。

    文章案例
    研究确定了一种新型转录因子(Activating Transcription Factor 3),发现它能防止心脏重塑发展。构建WT或ATF3KO小鼠,从中各自分离成纤维细胞,并进行转录组测序,通路富集分析发现ATF3参与调控众多通路。为进一步筛选出核心通路,研究构建通路网络图(Pathway Network)发现下游效应性通路MAPK signaling pathway。(转录组测序+数据分析由中康博提供)



    参考文献:Yulin Li et al. Cardiac Fibroblast-Specific Activating Transcription Factor 3 Protects Against Heart Failure by Suppressing MAP2K3-p38 Signaling. Circulation. 2017.



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