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    数据分析服务

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    cnkingbio

  全局信号转导网络—Global Signal Transduction Network

   
        利用数据库中KEGG、BIND、HPRD等信号传递通路，以及基因、蛋白质、化合物之间的作用关系，构建目标基因群中，基因与基因产物间的信号传递网络，通过信号转导网络得到基因间的相互作用关系，信号转导网络通过图论分析方法可以得到网络的核心调节基因，反映样本在全局层面的基因调节机制。

  

   

  
  文章案例1：研究构建H2AX低表达A549细胞，与对照A549细胞进行表达谱检测，经差异分析和功能通路富集分析后，构建全局信号转导网络，根据属性值degree筛选排名前十的基因，进一步采用PCR验证。（芯片检测+数据分析由中康博提供）

   

  

  
  
  参考文献：Chengrong Lu et al. Genome-wide transcriptional analysis of apoptosis-related genes and pathways regulated by H2AX in lung cancer A549 cells. Apoptosis. 2013 .
   
  文章案例2：实验分为对照组 和SiNPs处理组，斑马鱼为研究对象，对两分组3:3样本进行表达谱检测， 经差异和功能通路富集后，进一步构建全局信号转导网络，筛选出核心的差异基因，并根据degree值及自身研究选择个基因（如jak1、jak2a）进一步验证。（芯片检测+数据分析由中康博提供）
   

  

  
  参考文献：Genome-wide transcriptional analysis of cardiovascular-related genes and pathways induced by PM2.5 in human myocardial cells. 2017. Environ Sci Pollut Res.

  
  

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