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参考报价: | 面议 | 型号: | 蛋白乙酰化检测 |
品牌: | 博恩生物 | 产地: | 南京 |
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1.乙酰化修饰简介
细胞是人体基本的结构与功能单位,主要通过蛋白质来执行复杂的任务,延续人体机能。好比打仗需要不同的兵器,
蛋白质执行不同的任务需要进行不同的“变异”,一旦蛋白质“被嫁接”上一种叫“乙酰基”的分子,它就“被修饰”
成了乙酰化蛋白质。蛋白质乙酰化指在乙酰基转移酶的作用下,在蛋白质赖氨酸残基上添加乙酰基的过程,是细胞控
制基因表达,蛋白质活性或生理过程的一种机制。揭开蛋白质“乙酰化修饰”机理机制,将为研究蛋白质修饰规律打
下重要基础。
研究者发现蛋白质乙酰化修饰参与包括转录调控、信号通路调控、代谢调控、蛋白质稳定性调控以及病原微生物
感染调控等多个重要生理功能。蛋白质中的赖氨酸乙酰化修饰还调控蛋白质的多种性质,包括DNA-蛋白质相互
作用、亚细胞定位、转录活性、蛋白质稳定性等,除了以上这些重要的生物学功能外,赖氨酸乙酰化蛋白质及其
调控酶与衰老和重大疾病(如神经变形紊乱、心血管疾病等)紧密相联。
2. 调控乙酰化修饰的酶和供体
要对某种修饰的机理和变化进行研究,就必须了解调控修饰的酶和供体,对于乙酰化修饰来说,它的供体即是乙
酰Acetylcoenzyme A,也是细胞生理生化代谢中核心TCA循环中关键节点。调控乙酰化修饰的酶主要分为乙酰
转移酶和去乙酰化酶:
(1)组蛋白乙酰转移酶(Histoneacetyltransferases,HATs)
组蛋白乙酰化酶通过对组蛋白赖氨酸残基进行乙酰化修饰,减弱DNA与组蛋白之间的相互作用,辅助激活基因转
录。组蛋白乙酰化酶主要分为以下几类:
1)P300/CBP 家族: 如 p300, CBP。
2)SRC/p160 核受体共激活家族: 例如 NCOA1, NCOA3。
3)GCN5 家族: 比如 KAT2a, KAT2b等。
4)MYST (SAS/MOZ) 家族: 如 MYST1, Kat5, MYST2, MYST3, MYST4等。
(2)组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HDACs)
组蛋白去乙酰化酶主要承担组蛋白乙酰化修饰的清除,辅助抑制基因转录。它们一般均包含一个催化去乙酰化的
结构域。一般参与组成多重复合物。HDACs主要被分为四类:
1) HDAC 1, 2, 3和 8;
2)HDAC 4, 5, 7 和9,以及HDAC 6 和10;
3) SIRT1 -7;
4)HDAC 11。
3、乙酰化的作用
非组蛋白的乙酰化涉及多种细胞过程和人类疾病。 因此,乙酰化调节酶和含乙酰赖氨酸Reader结构域的蛋白质是
很好的治疗靶标。
3.1 基因转录
蛋白质乙酰化是基因转录的主要调节因子。大多数KAT定位于细胞核,并起转录共激活的作用。几乎所有乙酰赖氨
酸结合的含bromodomain蛋白都定位于细胞核,其中许多直接参与转录调控。乙酰化涉及调节超过100种包括转录
因子,转录共激活因子和核受体在内的非组蛋白。 因此,基因转录的调节是非组蛋白乙酰化的主要作用。
2.2 细胞周期
在DNA复制期间,姐妹染色单体通过cohesin复合物配对,直到有丝分裂才分离。 SMC3的ATP酶的头部是cohesin
复合物的关键组分,在两个保守残基Lys105和Lys106处会被乙酰化。 一旦SMC3加载到DNA上,SMC3的乙酰化就
会锁住cohesin环,使姐妹染色单体结合更加紧密。
3.3 DNA损伤修复
例如,共济失调毛细血管扩张症突变(Ataxia telangiectasia mutated, ATM)是DNA双链断裂(DSB)修复的关
键调节因子。 TIP60乙酰化并激活ATM以响应DNA损伤,TIP60的失活使细胞对电离辐射敏感。
此外,乙酰化通过调节NHEJ促进因子TP53结合蛋白1(53BP1)向DNA损伤位点的募集来调节非同源末端连接
(NHEJ)和同源定向修复(HDR)之间的DSB修复途径选择。值得注意的是,CBP直接乙酰化53BP1也会干扰
53BP1招募受损的染色质。
3.4 细胞信号
CBP可以介导RAS1激酶抑制因子(CNK1;也称为CNKSR1)增强子的pleckstrin同源结构域(PH结构域)的乙酰化。
PH结构域乙酰化驱动CNK1定位于质膜,其中它与丝氨酸/苏氨酸激酶RAF相互作用诱导ERK依赖性细胞增殖和迁移。
ERK信号的激活形成反馈调节,加强CNK1乙酰化。
胰岛素受体底物2(IRS2)是胰岛素和胰岛素样生长因子1(IGF1)信号传导的关键接头分子。SIRT1催化IRS2脱乙
酰化,增强其磷酸化水平并增强ERK信号。 SIRT1的抑制作用增强IRS2乙酰化水平,并且可能通过促进IRS2去磷酸
化来抑制IGF1信号传导。
3.5 细胞骨架重排
微管由α-和β-微管蛋白聚合构成。它是真核生物细胞骨架的主要成分。TAT1通过微管末端进入微管,催化α-微管
蛋白的Lys40乙酰化。该位点被HDAC6去乙酰化。Cortactin受到CBP和p300介导的乙酰化调控,它与F-肌动蛋白
结合并有助于肌动细胞骨架蛋白重排和细胞迁移。乙酰化的cortactin主要定位于细胞核,降低了与KEAP1的结合
并抑制细胞迁移,而HDAC6依赖的去乙酰化促进细胞motion。
3.6 蛋白聚集
据报道,蛋白聚集跟多种神经疾病有关。多种倾向于聚集的蛋白可以被乙酰化修饰,而且乙酰化修饰的蛋白影响
蛋白聚集的概率。
以TDP43为例,TDP43与肌萎缩性脊髓侧索硬化有关。乙酰化阻碍TDP43与RNA结合,促进不溶性的高磷酸化
修饰的TDP43形成。
3.7 乙酰化对酶的调控
乙酰化通过多种机制调节分布于细胞各区域的40多种酶。
3.7.1 抑制酶的活性
Acetylcoenzyme A合成酶1(ACSS1)和ACSS2分别定位于细胞质基质和线粒体。乙酰化会抑制ACSS1和ACSS2的
活性,而SIRT1和SIRT3介导的去乙酰化能恢复ACSS1和ACSS2的活性。另外,KAT9介导的葡萄糖-6-磷酸脱氢酶
(G6PD)抑制G6PD二聚体形成,从而抑制G6PD的活性。
3.7.2 增强酶的活性
包括p300,PCAF和KAT8在内的乙酰化酶可以发生自乙酰化,乙酰化的KATs的活性可以得到提高。这种机制类
似于蛋白激酶的自磷酸化。
3.7.3 改变酶-底物特异性
乙酰化能改变E3泛素连接酶MDM2的底物特异性。MDM2的Lys182,Lys185位点会被p300乙酰化,使MDM2与
去乙酰化酶USP7结合,从而使MDM2的底物p53泛素化。在基因毒性压力下,SIRT2催化MDM2去乙酰化反应,
降低p53泛素化水平,增强p53稳定性,从而触发细胞凋亡。
3.8 蛋白降解的调控
乙酰化既可以调控蛋白酶体依赖的,又可以调控不依赖蛋白酶体的蛋白降解体系。
3.8.1 泛素化与蛋白酶体依赖的蛋白降解途径
一般来讲,乙酰化依赖的蛋白质稳定性的机制是防止蛋白质泛素化,从而抑制蛋白酶体的降解。乙酰化和泛素化
可能竞争同一个赖氨酸位点。比如,p300可以介导SMAD7 Lys 六十四和Lys70位点乙酰化,阻止SMAD7被泛素
调节因子1 (SMURF1)泛素化,从而防止SMAD7被降解。
另一方面,乙酰化可以通过增强泛素化加快蛋白降解。PEPCK1乙酰化可招募E3泛素连接酶UBR5,导致PEPCK1
降解。DNMT1乙酰化会促进UHRF1对DNMT1的泛素化作用,导致DNMT1降解。
3.8.2 不依赖蛋白酶体的降解途径
除了依赖蛋白酶体降解途径之外,乙酰化也可以通过介导不依赖蛋酶体的降解途径调节蛋白质稳定性。例如,丙
酮酸激酶PKM乙酰化通过激活自噬通路降解蛋白。
3.9 蛋白质相互作用
非组蛋白的乙酰化可以促进或抑制蛋白质-蛋白质相互作用。据报道,bromodomain与乙酰化蛋白相结合。人类
蛋白组中包含61种bromodomain,分布于46种蛋白之中,而这些蛋白几乎都是核蛋白。Bromodomain相互作
用的特点在于低亲合力和配体的杂乱性,这样可以提高响应性,与多种配体结合。结合串联的bromodomain和
结合多重乙酰化蛋白可增加蛋白质之间的亲合力。
例如,转录因子C-ets-1(ETS1)在其氨基末端的两个残基处的乙酰化促进其与BRD4的相互作用和RNA聚合酶II
(Pol II)的释放。转录调节因子TWIST的乙酰化促进其与BRD4的第二个bromodomain的相互作用,而BRD4
的第一个bromodomain与乙酰化组蛋白H4相互作用,从而促进包含TWIST,BRD4,Pol II的复合物形成,以及
编码WNT5A基因启动子和增强子的阳性转录延伸因子b(P-TEFb)复合物的形成。
3.10 调节亚细胞定位
乙酰化调节许多非组蛋白定位。S期激酶相关蛋白2(SKP2)核定位信号(NLS)上的乙酰化促进其细胞质保留
并抑制其降解。同样,病毒感染引发病毒-DNA Induction蛋白IFI16核定位序列的乙酰化,从而促进其细胞质定位。
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