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16s/18s/ITs微生物多样性测序

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参考报价: 面议 型号: 16s/18s/ITs微生物多样性测序
品牌: 舍为斯生物 产地: 天津
关注度: 暂无 信息完整度:
样本: 暂无样本 典型用户: 暂无
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产品简介

       扩增子测序,即对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序,主要包括16S rDNA测序、18S rDNA测序及ITS测序等。扩增子测序通常是选择某个或某几个变异区域,利用保守区设计通用引物进行PCR扩增,然后对高变区进行测序分析和菌种鉴定,具有所需样本量少、高通量和高精确性等特点。


数据分析策略

1.从测序所得的原始数据出发,首先对原始数据进行质控,得到有效数据(Clean Data);

2.基于有效数据进行OTUs(Operational Taxonomic Units)聚类;

3.根据OTUs聚类结果,一方面对每个OTU的代表序列做物种注释,得到对应的物种信息,另一方面将各个样品的有效数据,和代表序列进行比对,获得对应OTU在各个样品中的丰度分布情况;

4.基于构建好的OTU丰度表,获得不同分类层级的物种丰度表;

5.基于OTU丰度表及不同分类层级的丰度表,进行样品微生物群落组成分析;

6.基于OTU丰度表及不同分类层级的丰度表,进行Alpha多样性和Beta多样性分析;

7.根据研究需求,可选择高级分析,深入挖掘样品中的物种组成和差异。


数据分析内容

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16s/18s/ITs微生物多样性测序信息由天津舍为斯生物技术有限公司为您提供,如您想了解更多关于16s/18s/ITs微生物多样性测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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