差异分析

1.分析目的
获取两个不同分组间的mRNA/lncRNA/miRNA表达、DNA位点甲基化的差异
2.数据来源
基因表达谱、非编码基因表达谱、DNA甲基化（客户自己测序，或者来源于GEO/TCGA等公共数据库的RNAseq、MicroArray、Methylation450K数据等）
3.分析方法
将样本分组为实验组和对照组，使用主流分析工具Limma[1]进行差异分析，所有基因经过统计检验后得到相应的P.Value值，使用Benjamini & Hochberg方法[2]进行多重检验校正。我们从log2差异倍数（logFC）和显著性（P.Value或adj.P.value）两个指标来衡量基因的差异表达水平，设定阈值（如adj.P.Value<=0.05且|logFC|>=1）对差异基因进行筛选
4.交付文件
（1）基因差异表达结果，包括各个基因的logFC、p value等信息（Excel）
（2）差异基因火山图；top差异基因表达值的聚类热图
5.分析结果示例图






 

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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途