宏基因组测序分析

宏基因组

宏基因组（Metagenomics）又称为元基因组，指特定生境中全部微小生物遗传物质的总和，包含了可培养的和不可培养的微生物基因。目前主要以生境中全部细菌、古菌和真菌基因组DNA为研究对象，研究其功能和彼此之间的关系和相互作用，从而揭示其内在机制。

随着分子生物学技术在微生物生态学研究中的广泛应用，促进了以强调微生物群落基因组为整体研究对象，研究特定生境中微生物群落结构、功能代谢、进化关系以及对环境因子的响应为主的微生物环境基因组学或称为宏基因组学技术。

以高通量测序为基础的宏基因组研究方法则可以直接对环境样品中分离的遗传物质进行深度测序，已经被证实在探索微生物生态生理特性、复杂环境微生物群落的代谢方式以及从核苷酸构建的文库中鉴定新型生物分子等方面有着不可替代的作用。宏基因组测序摆脱了传统研究中微生物分离培养较难的技术限制，直接提取环境样本DNA进行测序，具有通量高、速度快、信息全等特点，在鉴定低丰度的微生物群落、挖掘更多基因资源方面具有很大优势，基于测序技术和生物信息学的快速发展，宏基因组测序在微生物研究中的应用范围越来越广。

罗宁生物测序分析优势

采用Illumina或Oxford Nanopore高通量测序平台，结合自主高性能计算机集群分析平台发掘微生物群落信息、物种分类、系统进化、基因功能及网络代谢等信息。
我们提供：
1、业内领先的多达88-126项测序分析服务；
2、灵活化测序选择平台和数据组装分析模式，为您提供优异性价比；
3、不断更新的功能注释数据库，保证基础分析也可获得NR, Swiss-Prot, eggNOG, KEGG,GO,CAZy,CARD, PHI等九大数据库全方位注释结果；
4、提供多组学联合分析，定制化分析满足全方位分析需求；
5、特有的Carrier RNA痕量DNA提取技术保证微量样品也可进行宏基因组测序分析；

 

技术路线

技术参数

样品要求

1. 新鲜样本 （请使用干冰运送）

  土壤、淤泥、沉积物， 5-10g

  肠道样本， 2-5g

  水体样本， 5-10L水样过滤后的滤膜

  拭子样本， 取样前请与技术支持联系获取详细信息

2. 纯化核酸样本 （请使用干冰或冰袋运输）

  纯化DNA样本，浓度大于30ng/μl，总量大于2μg。核酸样本主带明显，无降解，无RNA或蛋白质污染。

3. 痕量样本
拭子、FTA卡或任意痕量样本（固体样品质量大于5mg、液体体积大于5μl或核酸浓度大于1ng/μl）