应用范围

1. 构建自己的转录组数据库；
2. 定量基因表达，找出关键基因；
3. 研究基因表达的可变剪接；
4. 结合其他组学数据，进行深入挖掘。

 
烈冰技术优势

1. 自主研发了国际认可的差异可变剪接算法——ASD，验证率高达80%，业内领先；
2. 烈冰科技根据实验设计提供ABI Ion Proton和illumina Hiseq4000两种高通量平台。并针对不同平台数据制定多套流程；
3. 国内率先使用Ion Proton测序平台，测序速度快，4小时内即可完成测序实验；同数据量的情况下，Ion Proton较Illumina Hiseq能测定更多的转录本，提供更为准确的基因表达数据；Ion Proton具有先天性链特异性，能将overlapped gene从基因表达中和他们的正向的基因区别开；
4. 精确到单核苷酸水平，可区分高度同源的RNA 分子，鉴定剪切变异体和RNA 多态性；
5. 整合众多学界公认数据库，从本质上提高后期分析的广度和精度；
6. 结合烈冰科技多年的生物信息分析体系和已发表高分文献分析思路，针对不同生物学问题提供定制化分析方案设计；
7. 提供多组学联合分析；

 
实验流程

 
 
分析流程

 
结果展示
差异表达基因火山图

 
基因聚类分析图


信号通路互作网络

 
Denovo拼接共表达分析网络

 
 
发表文献

1. , et al. Autism-like behaviours and germline transmission in transgenic monkeys overexpressing MeCP2.  2016 Feb 4;530(7588):98-102.
2. , et al. Transcriptomic analysis of hepatic responses to testosterone deficiency in miniature pigs fed a high-cholesterol diet.  2015 Feb 6;16:59.
3. Xu T, et al. SP1-induced upregulation of the long noncoding RNA TINCR regulates cell proliferation and apoptosis byaffecting KLF2 mRNA stability in gastric cancer.  2015 Nov 5;34(45):5648-61.
4. Xu T, et al. SP1-induced upregulation of the long noncoding RNA TINCR regulates cell proliferation and apoptosis by affecting KLF2 mRNA stability in gastric cancer.  2015 Mar 2.
5. Wang F, et al. Alternative splicing of the androgen receptor in polycystic ovary syndrome.  2015 Apr 14;112(15):4743-8.
6. Zhou X, et al. Transcriptome analysis of alternative splicing events regulated by SRSF10 reveals position-dependent splicing modulation.  2014 Apr;42(6):4019-30.

 

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