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空间转录组测序服务

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参考报价: 面议 型号: 空间转录组测序服务
品牌: 烈冰科技 产地: 上海
关注度: 暂无 信息完整度:
样本: 暂无样本 典型用户: 暂无
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空间转录组是指保留组织内部精细区域的空间信息的转录组测序。一次实验即可得到全部基因表达,并比对至相应的 H&E 染色图像,达到图像化和数字化的高度整合分析。
 
空间转录组学分析可展示组织切片中不同区域的基因表达情况,揭示精细病理区域中激活的信号通路,完成分子特征驱动病理特征的机制解析。空间转录组以分子方式定义病理,完成了病理数字化结合病理影像化的革新,将在未来的精准医疗、免疫治疗研究中发挥重要作用。
 
—— 空间转录组测序能干什么?——

病理学研究,探究细胞分化发育过程
揭示肿瘤微环境及异质性
研究免疫浸润,免疫扩散和免疫细胞空间位置解析
神经科学领域揭示大脑皮层结构
解析不同发育阶段基因表达特征阴性 / 假阳性的位置
 
—— 技术原理 ——
当组织冷冻切片附在带有 spatial barcode 的空间转录组芯片上时,通过透化处理,细胞内的 mRNA 释放出来,从而被芯片上上百万个带有oligo-dT 的探针捕获,每个探针上都带有独特的 spatial barcodes,用以标记捕获的 mRNA 的空间位置,可以将每个 mRNA转录的序列映射回组织切片中的原始位置。




—— 技术优势 ——

保留组织形态结构,获得基因在空间上的分布信息
结合HE染色,获得不同组织形态结构下的细胞组成信息
结合单细胞数据,获得细胞在空间上的分布信息
一次实验即可得到全部基因表达
样本直接冰冻切片,避免消化过程带来的细胞类型/基因表达的偏差

 

—— 烈冰服务方案 ——

实验平台

率先拥有先进的冷冻切片机LEICA CM1950,3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的数字切片扫描仪,搭配经验丰富的实验团队,对多种组织类型的切片厚度与切片温度进行测试优化,同时实现明场与荧光场下冷冻切片的快速扫描成像;Z-Stack多层聚焦扫描及Extended Focus 景深扩展多层融合扫描模式,进一步提升分辨率和清晰度,保证切片高分辨的数字图像信息精准采集。


实验流程

样本要求
样本类型:新鲜组织直接 OCT 包埋后干冰速冻,注意标明样本方向,样本于-80℃保存。
质量要求:样本大小尽量<6.5mm×6.5mmRIN值>7,若样本充足,可份及以上用作备份。
 

数据分析流程
针对每个样本的空间转录组测序数据,对所有检测到的细胞进行分群,并鉴定细胞的类型,可以在不同分组间从细胞类型的组成和丰度角度进行比较。

结果示例
 





 

烈冰生物具备全套空间转录组实验平台,为您提供完整的全服务流程,涉及各种类型样本制备、完善的实验质控流程、个性化的数据分析。


空间转录组测序服务信息由上海烈冰生物医药科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于空间转录组测序服务报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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